El aluminio (Al) se solubiliza como Al fitotóxico en suelos ácidos, inhibiendo rápidamente la elongación de las raíces. Para desintoxicar el Al, las raíces de las plantas secretan ácidos orgánicos que quelan el ion. El factor de transcripción SENSITIVE-TO-PROTON-RHIZOTOXICITY1 (STOP1) regula la exportación, distribución y metabolismo de los ácidos orgánicos, lo cual es crucial para la resistencia al Al. Se presume que los transportadores de dicarboxilatos (DICs) de las plantas ubicados en la membrana mitocondrial interna intercambian los dicarboxilatos. Sin embargo, no está claro si el Al o STOP1 modulan la expresión para coordinar el transporte de ácidos orgánicos. Aquí, en la leguminosa modelo, identificamos tres genes y doce en tetraploide. El análisis filogenético coloca todos los DICs de Medicago en un clado con Arabidopsis AtDIC1 y AtDIC2, mientras que carece de un ortólogo en. La minería de conjuntos de datos de RNA-seq seguida de validación por qRT-PCR mostró que se regula al alza por Al en raíces de manera dependiente de MtSTOP1. De manera consistente, existen motivos de unión a STOP1 en el promotor, y MtSTOP1 se une al promotor en levaduras. Además, muestra un aumento bajo tratamiento con Al. Nuestro estudio proporciona una caracterización a nivel genómico de los DICs de Medicago e identifica como un objetivo candidato de MtSTOP1, cuya inducción en respuesta al Al puede aumentar el flujo de ácidos orgánicos a través de la membrana mitocondrial.