Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de la familia de genes en
Autores: Zhang, Xule; Feng, Lei; Hu, Qingdi; Hu, Yaping; Ma, Xiaohua; Zheng, Jian
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Squamosa
Proteína similar a la unión de promotores
Dominios sbp
Análisis filogenético
Estructura génica
Perfil de expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La familia de proteínas similares al factor de unión al promotor SQUAMOSA (SPL/SBP) desempeña roles cruciales en múltiples procesos de desarrollo. Es una especie ornamental y de cría clave conocida por producir abundantes flores coloridas en una sola inflorescencia. La familia de genes en esta especie sigue siendo en gran medida no caracterizada. En este estudio, se identificaron 15 genes, todos codificando proteínas que se predice bioinformáticamente que están localizadas en el núcleo, son hidrofílicas e inestables, con dominios SBP conservados. Los análisis filogenéticos y de colinealidad revelaron una relación evolutiva más cercana con el arroz que con Arabidopsis. Los análisis de motivos conservados y de estructura génica mostraron que los miembros de la subfamilia II poseen más motivos e intrones, lo que implica complejidad funcional. Cinco PeqSPLs contenían dominios transmembrana, sugiriendo posibles roles duales nucleares/citoplasmáticos. El análisis del promotor reveló abundantes elementos -responsivos a la luz, estrés y fitohormonas. El perfil de expresión en diferentes tejidos mostró que, y, exhibieron una amplia expresión y mostraron predominantemente alta expresión en flores, indicando posibles roles en el crecimiento normal y el desarrollo floral. Este estudio proporciona una base para una exploración funcional adicional de los genes en.
Descripción
La familia de proteínas similares al factor de unión al promotor SQUAMOSA (SPL/SBP) desempeña roles cruciales en múltiples procesos de desarrollo. Es una especie ornamental y de cría clave conocida por producir abundantes flores coloridas en una sola inflorescencia. La familia de genes en esta especie sigue siendo en gran medida no caracterizada. En este estudio, se identificaron 15 genes, todos codificando proteínas que se predice bioinformáticamente que están localizadas en el núcleo, son hidrofílicas e inestables, con dominios SBP conservados. Los análisis filogenéticos y de colinealidad revelaron una relación evolutiva más cercana con el arroz que con Arabidopsis. Los análisis de motivos conservados y de estructura génica mostraron que los miembros de la subfamilia II poseen más motivos e intrones, lo que implica complejidad funcional. Cinco PeqSPLs contenían dominios transmembrana, sugiriendo posibles roles duales nucleares/citoplasmáticos. El análisis del promotor reveló abundantes elementos -responsivos a la luz, estrés y fitohormonas. El perfil de expresión en diferentes tejidos mostró que, y, exhibieron una amplia expresión y mostraron predominantemente alta expresión en flores, indicando posibles roles en el crecimiento normal y el desarrollo floral. Este estudio proporciona una base para una exploración funcional adicional de los genes en.