Este estudio tiene como objetivo estimar la proporción y diversidad de bacterias del suelo derivadas de métodos basados en eDNA y en cultivos. Específicamente, utilizamos Illumina Miseq para secuenciar y caracterizar las comunidades bacterianas de (i) ADN extraído directamente del suelo del bosque y (ii) ADN extraído de una mezcla de colonias bacterianas obtenidas mediante cultivos de enriquecimiento en placas de agar de las mismas muestras de suelo del bosque. La secuenciación de amplicones de cultivos de enriquecimiento nos permitió examinar rápidamente una comunidad cultivable en una muestra ambiental. En comparación con una comunidad de eDNA (basada en un umbral de similitud de secuencia del 97%), se demostró que los cultivos de enriquecimiento podían capturar tanto taxones bacterianos raros como abundantes en muestras de suelo del bosque. Las comunidades de cultivos de enriquecimiento y eDNA compartieron el 2% de los OTUs detectados en la comunidad total, mientras que el 88% de la comunidad de cultivos de enriquecimiento (15% de la comunidad total) no pudo ser detectado por eDNA. Los métodos basados en cultivos de enriquecimiento observaron el 17% de las bacterias en la comunidad total. La predicción funcional de FAPROTAX mostró que los taxones raros y únicos, que fueron detectados con los cultivos de enriquecimiento, tienen el potencial de realizar funciones importantes en los sistemas del suelo. Sugerimos que la secuenciación de amplicones basada en cultivos de enriquecimiento podría ser un enfoque beneficioso para evaluar una comunidad bacteriana cultivada. Combinar este enfoque junto con el método de eDNA podría proporcionar información más completa sobre una comunidad bacteriana. Esperábamos que se pudieran detectar más taxones cultivados únicos si estudios adicionales utilizaran medios de cultivo selectivos y no selectivos para enriquecer bacterias en el primer paso.