Análisis sistemático de la familia de genes y su perfil de expresión identifica posibles genes candidatos clave involucrados en las respuestas al estrés abiótico
Autores: Guo, Shengzhou; Xu, Yuan; Zhou, Yi; Liu, Ronglin; Wang, Yongkang; Yao, Ling; Azam, Syed Muhammad; Ma, Huanhuan; Liu, Xiaomin; Cao, Shijiang; Wang, Kang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factor de transcripción tcp
Reguladores específicos de plantas
Estrés ambiental
Análisis a nivel genómico
Localización subcelular
Respuestas al estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 3
Citaciones: Sin citaciones
La familia de factores de transcripción TCP es un conjunto vital de reguladores específicos de plantas involucrados en el crecimiento, desarrollo y respuestas a estrés ambiental en las plantas. A pesar de la extensa investigación sobre los factores de transcripción TCP en numerosas especies de plantas, las funciones que cumplen aún no se comprenden bien. En este estudio, se identificaron 21 genes a través de un análisis genómico. Se utilizó análisis bioinformático para examinar las propiedades fisicoquímicas de estos factores de transcripción, incluyendo peso molecular, punto isoeléctrico, distribución cromosómica y localización subcelular predicha. Esperábamos que la mayoría de los factores de transcripción BpTCP se localizaran en el núcleo. El análisis de colinealidad reveló que los eventos de duplicación de fragmentos de genes jugaron un papel importante en la expansión evolutiva y diversificación de la familia de genes. El análisis de promotores identificó diversos elementos de acción en , sugiriendo que juegan un papel en las respuestas al estrés, regulación hormonal y crecimiento y desarrollo de las plantas. El análisis de qRT-PCR mostró que los genes exhibieron patrones de expresión específicos de tejido en las raíces, tallos y hojas, mostrando diferencias notables en los niveles de expresión cuando se sometieron a estrés abiótico, incluyendo sequía y condiciones de alta y baja temperatura. Notablemente, y mostraron niveles de expresión marcadamente más altos bajo múltiples condiciones de estrés. Los experimentos de localización subcelular confirmaron que tanto como localizan en el núcleo, consistente con las predicciones bioinformáticas. Estos hallazgos enfatizan los roles potenciales de y en la mediación de respuestas al estrés abiótico, destacando su potencial como genes candidatos para mejorar la tolerancia al estrés en .
Descripción
La familia de factores de transcripción TCP es un conjunto vital de reguladores específicos de plantas involucrados en el crecimiento, desarrollo y respuestas a estrés ambiental en las plantas. A pesar de la extensa investigación sobre los factores de transcripción TCP en numerosas especies de plantas, las funciones que cumplen aún no se comprenden bien. En este estudio, se identificaron 21 genes a través de un análisis genómico. Se utilizó análisis bioinformático para examinar las propiedades fisicoquímicas de estos factores de transcripción, incluyendo peso molecular, punto isoeléctrico, distribución cromosómica y localización subcelular predicha. Esperábamos que la mayoría de los factores de transcripción BpTCP se localizaran en el núcleo. El análisis de colinealidad reveló que los eventos de duplicación de fragmentos de genes jugaron un papel importante en la expansión evolutiva y diversificación de la familia de genes. El análisis de promotores identificó diversos elementos de acción en , sugiriendo que juegan un papel en las respuestas al estrés, regulación hormonal y crecimiento y desarrollo de las plantas. El análisis de qRT-PCR mostró que los genes exhibieron patrones de expresión específicos de tejido en las raíces, tallos y hojas, mostrando diferencias notables en los niveles de expresión cuando se sometieron a estrés abiótico, incluyendo sequía y condiciones de alta y baja temperatura. Notablemente, y mostraron niveles de expresión marcadamente más altos bajo múltiples condiciones de estrés. Los experimentos de localización subcelular confirmaron que tanto como localizan en el núcleo, consistente con las predicciones bioinformáticas. Estos hallazgos enfatizan los roles potenciales de y en la mediación de respuestas al estrés abiótico, destacando su potencial como genes candidatos para mejorar la tolerancia al estrés en .