El color de la cáscara es una de las características agronómicas más cruciales de la sandía (L.). Se realizó un análisis genético para proporcionar la identificación de genes que regulan el color de la cáscara y mejoran la calidad de la apariencia de la sandía. En este estudio, se utilizó una población de mapeo de 505 plantas F, derivadas de un cruce entre cáscaras verdes (CG058) y cáscaras verde claro (CG265), junto con un enlace genético de alta densidad (distancia promedio de 0.9 cM entre marcadores de bin), para mapear e identificar posibles genes candidatos. Se determinó que el rasgo de la cáscara verde está regulado por un único locus mendeliano y se localizó con precisión dentro de un sitio genómico de 110 kb en el cromosoma nueve (Chr 9). En la región respectiva, dos genes potenciales, y , fueron sustancialmente regulados a la baja en la cáscara verde claro en comparación con la cáscara verde. Estudios previos revelaron que , que codifica una proteína similar a un regulador de respuesta de dos componentes (APRR2), está posiblemente involucrado en el rasgo de la cáscara verde en la sandía. Un ensayo de silenciamiento génico inducido por virus (VIGS) confirmó que es un gen clave responsable del color de la cáscara verde. Además, el análisis de qRT-PCR reveló que los niveles de transcripción de múltiples genes clave en la vía de biosíntesis de clorofila (Chl) estaban regulados a la baja en la cáscara verde claro en relación con la cáscara verde. Los hallazgos actuales tienen el potencial de aclarar los mecanismos regulatorios que subyacen al color de la cáscara de la sandía. Estos datos proporcionarían valiosos conocimientos para el diseño molecular dirigido y el desarrollo de cáscaras de sandía.