Identificación de Genes Candidatos Clave en Corridas de Homocigosis del Genoma de Dos Razas de Gallinas, Asociados con la Adaptación al Frío
Autores: Fedorova, Elena S.; Dementieva, Natalia V.; Shcherbakov, Yuri S.; Stanishevskaya, Olga I.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
Es bien conocido que los bancos genéticos de pollo tienen altas habilidades adaptativas, incluida la adaptación a entornos fríos. Esta investigación tuvo como objetivo estudiar la distribución genómica de los tramos de homocigosidad (ROH) en una población de pollos Rusos Blancos (RW) como resultado de la selección para la adaptación a entornos fríos en el período postnatal temprano, realizar una anotación estructural de las regiones específicas de la raza del genoma descubiertas (en comparación con los pollos de la raza Amroks) y sugerir genes candidatos clave asociados con la adaptación de los pollos RW a entornos fríos. La genotipificación de muestras individuales se realizó utilizando chips Illumina Chicken 60K SNP BeadChip. La búsqueda de regiones homocigotas por cromosomas individuales se llevó a cabo utilizando el programa PLINK 1.9 y el paquete R detectRuns. Se identificaron doce genes clave en islas ROH específicas de la raza. Pueden considerarse como posibles genes candidatos asociados con la alta capacidad adaptativa de los pollos en entornos fríos en el período postnatal temprano. Los genes asociados con el metabolismo de lípidos, el mantenimiento de la temperatura corporal en entornos fríos, la termogénesis sin temblor y el desarrollo muscular son perspectivas para futuras investigaciones. Este estudio contribuye a nuestra comprensión de los mecanismos de adaptación a entornos fríos en los pollos y proporciona una base molecular para el trabajo de selección.
Descripción
Es bien conocido que los bancos genéticos de pollo tienen altas habilidades adaptativas, incluida la adaptación a entornos fríos. Esta investigación tuvo como objetivo estudiar la distribución genómica de los tramos de homocigosidad (ROH) en una población de pollos Rusos Blancos (RW) como resultado de la selección para la adaptación a entornos fríos en el período postnatal temprano, realizar una anotación estructural de las regiones específicas de la raza del genoma descubiertas (en comparación con los pollos de la raza Amroks) y sugerir genes candidatos clave asociados con la adaptación de los pollos RW a entornos fríos. La genotipificación de muestras individuales se realizó utilizando chips Illumina Chicken 60K SNP BeadChip. La búsqueda de regiones homocigotas por cromosomas individuales se llevó a cabo utilizando el programa PLINK 1.9 y el paquete R detectRuns. Se identificaron doce genes clave en islas ROH específicas de la raza. Pueden considerarse como posibles genes candidatos asociados con la alta capacidad adaptativa de los pollos en entornos fríos en el período postnatal temprano. Los genes asociados con el metabolismo de lípidos, el mantenimiento de la temperatura corporal en entornos fríos, la termogénesis sin temblor y el desarrollo muscular son perspectivas para futuras investigaciones. Este estudio contribuye a nuestra comprensión de los mecanismos de adaptación a entornos fríos en los pollos y proporciona una base molecular para el trabajo de selección.