Identificación de Módulos Clave y Genes Candidatos para la Resistencia al Oídio del Trigo - Línea de Translocación WAT-2020-17-6 mediante WGCNA
Autores: Yao, Mingming; Wang, Xinhua; Long, Jiaohui; Bai, Shuangyu; Cui, Yuanyuan; Wang, Zhaoyi; Liu, Caixia; Liu, Fenglou; Wang, Zhangjun; Li, Qingfeng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Enfermedad
Trigo
Resistencia
Genes
Oídio
Cría
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Como una de las enfermedades graves del trigo, el oídio (f. sp.) es una amenaza a largo plazo para la producción de trigo. Por lo tanto, es de gran importancia explorar nuevos genes resistentes al oídio para la mejora genética. Las especies silvestres relacionadas con el trigo proporcionan recursos genéticos para la resistencia en la mejora del oídio. (2n = 4x = 28, genomas PPPP) es un pariente silvestre importante del trigo, que lleva excelentes genes para alto rendimiento, resistencia a enfermedades y resistencia al estrés, que pueden ser utilizados para la mejora del trigo. Para entender el mecanismo molecular de la resistencia al oídio en la línea de translocación de trigo WAT2020-17-6, se realizó secuenciación de transcriptomas y se analizaron los genes de resistencia mediante análisis de red de coexpresión génica ponderada (WGCNA). En los resultados, se identificaron 42,845 genes expresados diferencialmente y se dividieron en 18 módulos, de los cuales seis módulos estaban altamente correlacionados con la resistencia al oídio. El análisis de enriquecimiento de ontología génica (GO) mostró que los seis módulos de interés relacionados con la resistencia al oídio estaban significativamente enriquecidos en actividad de N-metiltransferasa, autofagia, empalme de ARNm a través del espliceosoma, envoltura de cloroplastos y unión de AMP. Los genes centrales candidatos de los módulos de interés fueron identificados y sus relaciones regulatorias fueron analizadas en base a datos de coexpresión. El patrón de expresión temporal de los 12 genes centrales fue verificado dentro de las 96 horas posteriores a la inoculación con oídio mediante ensayo de RT-PCR. En este estudio, explicamos preliminarmente el mecanismo de resistencia de las líneas de translocación de trigo y obtuvimos los genes centrales candidatos, lo que sentó una base en la exploración de genes de resistencia para la mejora del trigo resistente al oídio.
Descripción
Como una de las enfermedades graves del trigo, el oídio (f. sp.) es una amenaza a largo plazo para la producción de trigo. Por lo tanto, es de gran importancia explorar nuevos genes resistentes al oídio para la mejora genética. Las especies silvestres relacionadas con el trigo proporcionan recursos genéticos para la resistencia en la mejora del oídio. (2n = 4x = 28, genomas PPPP) es un pariente silvestre importante del trigo, que lleva excelentes genes para alto rendimiento, resistencia a enfermedades y resistencia al estrés, que pueden ser utilizados para la mejora del trigo. Para entender el mecanismo molecular de la resistencia al oídio en la línea de translocación de trigo WAT2020-17-6, se realizó secuenciación de transcriptomas y se analizaron los genes de resistencia mediante análisis de red de coexpresión génica ponderada (WGCNA). En los resultados, se identificaron 42,845 genes expresados diferencialmente y se dividieron en 18 módulos, de los cuales seis módulos estaban altamente correlacionados con la resistencia al oídio. El análisis de enriquecimiento de ontología génica (GO) mostró que los seis módulos de interés relacionados con la resistencia al oídio estaban significativamente enriquecidos en actividad de N-metiltransferasa, autofagia, empalme de ARNm a través del espliceosoma, envoltura de cloroplastos y unión de AMP. Los genes centrales candidatos de los módulos de interés fueron identificados y sus relaciones regulatorias fueron analizadas en base a datos de coexpresión. El patrón de expresión temporal de los 12 genes centrales fue verificado dentro de las 96 horas posteriores a la inoculación con oídio mediante ensayo de RT-PCR. En este estudio, explicamos preliminarmente el mecanismo de resistencia de las líneas de translocación de trigo y obtuvimos los genes centrales candidatos, lo que sentó una base en la exploración de genes de resistencia para la mejora del trigo resistente al oídio.