Análisis exhaustivo de la familia de genes en la uva (L.) e identificación de y como reguladores negativos de la maduración de la fruta
Autores: Li, Kaidi; Liu, Kai; Wang, Keyi; Pang, Yunning; Zhang, Xuzhe; Li, Xiujie; Li, Bo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Fosfatasa de proteínas 2cs
Familia de genes
Uva
Respuestas al estrés
ácido abscísico
Maduración de frutos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Las fosfatasa 2C de proteínas (PP2C) son miembros de la familia de fosfatasas de serina/treonina que desempeñan roles fundamentales en la regulación del desarrollo de las plantas y las respuestas a estrés ambiental. Sin embargo, no se han realizado estudios genómicos exhaustivos de la familia de genes en la uva (Vitis vinifera). En el presente estudio, se identificaron 78 genes y se clasificaron en 12 clados según sus relaciones filogenéticas. El análisis de propiedades fisicoquímicas y arquitecturas de genes/proteínas reveló que los miembros dentro de cada clado compartían características estructurales conservadas. El análisis de sinonimia demostró que tanto las duplicaciones en tándem como las segmentales contribuyeron sustancialmente a la expansión de la familia de genes. Los perfiles de transcripción específicos de tejidos y los análisis de elementos cis indicaron la posible participación de estos genes en el desarrollo de la uva y las respuestas al estrés. Además, el análisis de expresión identificó a los genes como los más responsivos al ácido abscísico (ABA), con patrones de expresión altamente correlacionados con el desarrollo de la baya de uva. La validación funcional en líneas de tomate transgénico demostró que la sobreexpresión de cualquiera de los genes retrasó notablemente la maduración de la fruta. En conjunto, este estudio proporciona nuevas perspectivas sobre la diversificación evolutiva y las funciones regulatorias de la familia de genes en la uva e identifica a como candidatos clave para elucidar los mecanismos de maduración mediada por ABA en frutas no climactericas.
Descripción
Las fosfatasa 2C de proteínas (PP2C) son miembros de la familia de fosfatasas de serina/treonina que desempeñan roles fundamentales en la regulación del desarrollo de las plantas y las respuestas a estrés ambiental. Sin embargo, no se han realizado estudios genómicos exhaustivos de la familia de genes en la uva (Vitis vinifera). En el presente estudio, se identificaron 78 genes y se clasificaron en 12 clados según sus relaciones filogenéticas. El análisis de propiedades fisicoquímicas y arquitecturas de genes/proteínas reveló que los miembros dentro de cada clado compartían características estructurales conservadas. El análisis de sinonimia demostró que tanto las duplicaciones en tándem como las segmentales contribuyeron sustancialmente a la expansión de la familia de genes. Los perfiles de transcripción específicos de tejidos y los análisis de elementos cis indicaron la posible participación de estos genes en el desarrollo de la uva y las respuestas al estrés. Además, el análisis de expresión identificó a los genes como los más responsivos al ácido abscísico (ABA), con patrones de expresión altamente correlacionados con el desarrollo de la baya de uva. La validación funcional en líneas de tomate transgénico demostró que la sobreexpresión de cualquiera de los genes retrasó notablemente la maduración de la fruta. En conjunto, este estudio proporciona nuevas perspectivas sobre la diversificación evolutiva y las funciones regulatorias de la familia de genes en la uva e identifica a como candidatos clave para elucidar los mecanismos de maduración mediada por ABA en frutas no climactericas.