La chalcona sintasa (CHS) juega un papel vital en la síntesis de flavonoides, influyendo en el crecimiento, desarrollo y respuestas de las plantas tanto a estrés biótico como abiótico. En este estudio, se identificaron 11 genes utilizando métodos bioinformáticos, con su distribución a través de cinco cromosomas y contigs no asignados. Cada gen contiene de 2 a 3 exones y de 3 a 8 motivos conservados. La predicción in silico sugirió que las proteínas PtrCHS están localizadas en el citoplasma. PtrCHS9 y PtrCHS11 comparten estructuras terciarias de proteínas idénticas. El análisis filogenético clasificó a los miembros de la familia en cuatro subgrupos. El análisis de sinonimia reveló un conjunto de pares de genes colineales. Entre y , se identificaron dos conjuntos de pares de genes colineales, mientras que se encontró un conjunto de este tipo entre y . El análisis de elementos promotores mostró la presencia de varios elementos de respuesta hormonal y de respuesta al estrés dentro de los promotores. Los datos de RNA-Seq demostraron patrones de expresión específicos de tejido de . Los resultados de RT-qPCR indicaron que todos los genes, excepto , responden al estrés salino con patrones dinámicos y específicos de cada miembro. Además, cuatro (, , , y ) se regulaban significativamente al alza en respuesta al tratamiento con frío. Notablemente, y mantuvieron altos niveles de expresión tanto a las 6 como a las 12 h, lo que implica que pueden ser actores clave en la respuesta al estrés por frío en . Se obtuvieron clones de y se construyeron vectores de sobreexpresión en preparación para la transformación genética. En general, este estudio proporciona una base sólida para futuras investigaciones sobre las funciones de .