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Identificación de marcadores genéticos para la predicción de la supervivencia de pacientes con adenocarcinoma de pulmón basada en el análisis integrado de datos multicuerpo
Construimos una predicción de riesgo relacionada con el pronóstico para pacientes con adenocarcinoma de pulmón mediante la integración de información ómica múltiple del grupo de información clínica del adenocarcinoma de pulmón y del genoma y transcriptoma. Se recogieron muestras de sangre y muestras de tejido pulmonar canceroso y paracanceroso de 480 pacientes con adenocarcinoma de pulmón. Se realizó la secuenciación del ADN y el ARN de las muestras de ADN y las muestras de ARN. El primer seguimiento se realizó 3 meses después del alta. Se recogió información clínica de los pacientes, como edad, sexo, antecedentes de tabaquismo y estadio TNM. El modelo de riesgos proporcionales de Cox evaluó más de 600 SNP potenciales relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón. Tras el análisis LASSO, se obtuvieron 4 SNP relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón (incluidos rs1059292, rs995343, rs2013335 y rs8078328). Mediante el modelo de riesgos proporcionales de Cox, se evaluaron 260 genes candidatos relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón. Tras el análisis posterior, se obtuvieron 3 genes relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón (LDHA, SDHC y TYMS). Todos los pacientes supervivientes se dividieron en un grupo de alto riesgo (n=170) y un grupo de bajo riesgo (n=170) en función de 4 SNP y 3 genes relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón. La tasa de supervivencia global de los pacientes del grupo de alto riesgo fue inferior a la del grupo de bajo riesgo. El índice de predicción del riesgo pronóstico construido mediante la combinación del grupo de información clínica y las características genómicas y transcriptómicas de la información multiómica puede distinguir eficazmente el pronóstico de los pacientes con adenocarcinoma de pulmón, lo que proporcionará un apoyo eficaz para el tratamiento preciso de los pacientes con adenocarcinoma de pulmón.
Autores: Yuwang, Bao; Jianxiong, Luo; Tianxing, Yu; Yang, Liu; Xiaohua, Li; Qiong, Lin; Hao, Wang
Idioma: Inglés
Editor: Hindawi
Año: 2021
Disponible con Suscripción Virtualpro
Artículo científico
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Hindawi
Journal of Nanomaterials
Volume 2021, Article ID 9997939, 6 pages
https://doi.org/10.1155/2021/9997939
Yuwang Bao1, Jianxiong Luo1, Tianxing Yu1, Yang Liu1, Xiaohua Li1, Qiong Lin1, Hao Wang2
1 , China
2 , China
Academic Editor: Songwen Tan
Contact: jnm@hindawi.com
Construimos una predicción de riesgo relacionada con el pronóstico para pacientes con adenocarcinoma de pulmón mediante la integración de información ómica múltiple del grupo de información clínica del adenocarcinoma de pulmón y del genoma y transcriptoma. Se recogieron muestras de sangre y muestras de tejido pulmonar canceroso y paracanceroso de 480 pacientes con adenocarcinoma de pulmón. Se realizó la secuenciación del ADN y el ARN de las muestras de ADN y las muestras de ARN. El primer seguimiento se realizó 3 meses después del alta. Se recogió información clínica de los pacientes, como edad, sexo, antecedentes de tabaquismo y estadio TNM. El modelo de riesgos proporcionales de Cox evaluó más de 600 SNP potenciales relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón. Tras el análisis LASSO, se obtuvieron 4 SNP relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón (incluidos rs1059292, rs995343, rs2013335 y rs8078328). Mediante el modelo de riesgos proporcionales de Cox, se evaluaron 260 genes candidatos relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón. Tras el análisis posterior, se obtuvieron 3 genes relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón (LDHA, SDHC y TYMS). Todos los pacientes supervivientes se dividieron en un grupo de alto riesgo (n=170) y un grupo de bajo riesgo (n=170) en función de 4 SNP y 3 genes relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón. La tasa de supervivencia global de los pacientes del grupo de alto riesgo fue inferior a la del grupo de bajo riesgo. El índice de predicción del riesgo pronóstico construido mediante la combinación del grupo de información clínica y las características genómicas y transcriptómicas de la información multiómica puede distinguir eficazmente el pronóstico de los pacientes con adenocarcinoma de pulmón, lo que proporcionará un apoyo eficaz para el tratamiento preciso de los pacientes con adenocarcinoma de pulmón.
Descripción
Construimos una predicción de riesgo relacionada con el pronóstico para pacientes con adenocarcinoma de pulmón mediante la integración de información ómica múltiple del grupo de información clínica del adenocarcinoma de pulmón y del genoma y transcriptoma. Se recogieron muestras de sangre y muestras de tejido pulmonar canceroso y paracanceroso de 480 pacientes con adenocarcinoma de pulmón. Se realizó la secuenciación del ADN y el ARN de las muestras de ADN y las muestras de ARN. El primer seguimiento se realizó 3 meses después del alta. Se recogió información clínica de los pacientes, como edad, sexo, antecedentes de tabaquismo y estadio TNM. El modelo de riesgos proporcionales de Cox evaluó más de 600 SNP potenciales relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón. Tras el análisis LASSO, se obtuvieron 4 SNP relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón (incluidos rs1059292, rs995343, rs2013335 y rs8078328). Mediante el modelo de riesgos proporcionales de Cox, se evaluaron 260 genes candidatos relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón. Tras el análisis posterior, se obtuvieron 3 genes relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón (LDHA, SDHC y TYMS). Todos los pacientes supervivientes se dividieron en un grupo de alto riesgo (n=170) y un grupo de bajo riesgo (n=170) en función de 4 SNP y 3 genes relacionados con el pronóstico del adenocarcinoma de pulmón. La tasa de supervivencia global de los pacientes del grupo de alto riesgo fue inferior a la del grupo de bajo riesgo. El índice de predicción del riesgo pronóstico construido mediante la combinación del grupo de información clínica y las características genómicas y transcriptómicas de la información multiómica puede distinguir eficazmente el pronóstico de los pacientes con adenocarcinoma de pulmón, lo que proporcionará un apoyo eficaz para el tratamiento preciso de los pacientes con adenocarcinoma de pulmón.