Los pigmentos naturales son un grupo bastante relevante de moléculas que están ampliamente distribuidas en la naturaleza, poseyendo un papel significativo en nuestra vida diaria. Además de sus colores, los pigmentos naturales actualmente son reconocidos por tener propiedades biológicas relevantes asociadas con beneficios para la salud, como actividades antitumorales, antiaterogénicas, antienvejecimiento y antiinflamatorias, entre otras. Algunos de estos compuestos están fácilmente asociados con frutas específicas (como los arándanos con antocianinas, la pitahaya roja con betalaínas o el tomate con licopeno), verduras (las zanahorias con carotenoides), hojas de plantas (clorofilas en hojas verdes o carotenoides en hojas de otoño amarillas y rojas) e incluso el tejido muscular de vertebrados (como la mioglobina). A pesar de ser menos populares como fuentes de pigmentos naturales, las hojas de plantas comestibles poseen una gran variedad de clorofilas, así como una alta variedad de carotenoides y antocianinas. El propósito de esta revisión es analizar críticamente todo el flujo de trabajo utilizado para identificar y cuantificar los pigmentos naturales más comunes (antocianinas, carotenoides y clorofilas) en hojas de plantas comestibles utilizando espectrometría de masas en tándem. A lo largo de la literatura existente, hay una falta de consistencia en los métodos utilizados para extraer y analizar estos compuestos, y esta revisión tiene como objetivo superar este problema. Además, la espectrometría de masas ha destacado en el contexto de la metabolómica, siendo actualmente una técnica ampliamente empleada en este campo. Para las tres clases de pigmentos, se examinarán los siguientes pasos: (i) prepreparación de la muestra, incluidos los disolventes y las condiciones de extracción; (ii) detalles de la separación cromatográfica y los experimentos de espectrometría de masas (iii) identificación y cuantificación de los pigmentos.