El control de la expresión génica por secuencias de ADN reguladoras es una característica genómica conservada. El gen de maíz es un locus que ocurre de forma natural y que sirve como un modelo mecánico para el control de la expresión génica desde un elemento distal y una forma de interacciones alélicas llamada paramutación. Dos epi-alelos producen fenotipos de pigmentación distintos correlacionados con el aumento de la transcripción y el silenciamiento de. Estas dinámicas transcripcionales dependen de una secuencia de repetición hepta-tándem ubicada a 100 kb río arriba del locus. En la condición heterocigota, el epi-alelo paramuta, convirtiendo de manera hereditaria el epi-alelo al estado epigenético y nivel de expresión de, produciendo plantas ligeramente pigmentadas. Para identificar proteínas asociadas a, utilizamos un enfoque de inmunoprecipitación de cromatina dirigida con un locus transgénico integrado de manera estable. Aplicando una estrategia de filtrado conservadora, detectamos varios factores esperados, incluyendo la ARN polimerasa II, así como las nuevas proteínas putativas de unión al ADN ZAG4 y DDT4. ZAG4 y DDT4 activaron la expresión de GAL usando como cebo en un híbrido de levadura, apoyando su posible interacción con esta secuencia. La identificación de proteínas asociadas exclusivamente con la cromatina proporciona información sobre posibles factores reguladores y ofrece una base para futuros estudios que investiguen sus roles en la regulación génica.