Identificación a Nivel Genómico de la Proteína Asociada a la Resistencia Natural de Macrófagos (NRAMP) y Análisis de Expresión Bajo Estrés por Metales Pesados en L
Autores: Hu, Xiaopan; Li, Xiaoxue; Zhu, Bin; Gu, Lei; Zeng, Tuo; Yu, Feng; Liu, Lang; Wang, Hongcheng; Du, Xuye
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Familia
Genes
Análisis
Membrana
Transportadores
Sorgo
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
La familia NRAMP (Proteína Asociada a la Resistencia Natural de Macrófagos) desempeña un papel fundamental como transportadores de membrana en las respuestas de las plantas al estrés por metales pesados. Este estudio identificó 12 genes en sorgo y realizó un análisis bioinformático exhaustivo. Los genes están distribuidos en siete cromosomas de sorgo. Análisis en profundidad de la estructura de los genes, motivos conservados, colinealidad y filogenia indicaron que la familia se divide en tres subfamilias, cada una exhibiendo características estructurales y de motivos únicas. El análisis de colinealidad sugirió que las duplicaciones de grandes fragmentos, en lugar de duplicaciones en tándem, fueron responsables de la expansión de la familia, resultando en un mayor número de genes en comparación con arroz. El análisis del transcriptoma de las partes aéreas y subterráneas de plántulas de sorgo bajo estrés salino-alcalino reveló que es un gen clave que exhibe expresión específica de tejido. Además, el análisis de qRT-PCR tras la exposición a tratamientos con Cd, Mn o Zn reveló expresión diferencial entre los genes. Las predicciones de localización subcelular indicaron que los doce NRAMPs se localizan principalmente en la membrana plasmática, con de nueve a doce dominios transmembrana, consistente con su función en el transporte de iones metálicos. La evidencia experimental confirmó que se localiza en la membrana plasmática. Estos hallazgos establecen una base para una comprensión más profunda de la estructura y función de la familia de genes de sorgo.
Descripción
La familia NRAMP (Proteína Asociada a la Resistencia Natural de Macrófagos) desempeña un papel fundamental como transportadores de membrana en las respuestas de las plantas al estrés por metales pesados. Este estudio identificó 12 genes en sorgo y realizó un análisis bioinformático exhaustivo. Los genes están distribuidos en siete cromosomas de sorgo. Análisis en profundidad de la estructura de los genes, motivos conservados, colinealidad y filogenia indicaron que la familia se divide en tres subfamilias, cada una exhibiendo características estructurales y de motivos únicas. El análisis de colinealidad sugirió que las duplicaciones de grandes fragmentos, en lugar de duplicaciones en tándem, fueron responsables de la expansión de la familia, resultando en un mayor número de genes en comparación con arroz. El análisis del transcriptoma de las partes aéreas y subterráneas de plántulas de sorgo bajo estrés salino-alcalino reveló que es un gen clave que exhibe expresión específica de tejido. Además, el análisis de qRT-PCR tras la exposición a tratamientos con Cd, Mn o Zn reveló expresión diferencial entre los genes. Las predicciones de localización subcelular indicaron que los doce NRAMPs se localizan principalmente en la membrana plasmática, con de nueve a doce dominios transmembrana, consistente con su función en el transporte de iones metálicos. La evidencia experimental confirmó que se localiza en la membrana plasmática. Estos hallazgos establecen una base para una comprensión más profunda de la estructura y función de la familia de genes de sorgo.