Identificación a Nivel Genómico de la Familia en Especies del Triángulo de U y Análisis de Su Expresión en
Autores: Inkabanga, Alain Tseke; Zhang, Qiheng; Wang, Shanshan; Li, Yanni; Chen, Jingyi; Huang, Li; Li, Xiang; Deng, Zihan; Yang, Xiao; Luo, Mengxin; Peng, Lingxia; Ren, Keran; Chai, Yourong; Xue, Yufei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Rasap
Proteína de unión al dominio sh
G3bp
Gránulos de estrés
Estrés abiótico
Estrés biótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
El dominio SH de RasAP (G3BP) es una familia de proteínas altamente conservada en organismos eucariotas que coordina la transducción de señales y la regulación génica post-transcripcional, y funciona en la formación de gránulos de estrés. Los G3BPs tienen roles importantes en el estrés abiótico/biótico en mamíferos, y investigaciones recientes sugieren que tienen funciones similares en plantas superiores. Esta familia contiene muchas semillas oleaginosas importantes, verduras y plantas ornamentales, pero no hay informes sobre la familia en especies. En este estudio, identificamos genes de la familia de seis especies del triángulo de U a nivel genómico. Luego analizamos su estructura génica, motivos proteicos, tipo de duplicación génica, filogenia, localización subcelular, loci SSR y miARNs ascendentes. Basándonos en datos de transcriptoma, analizamos los patrones de expresión de los genes en varios tejidos/órganos en respuesta a enfermedades, enfermedad del pie negro, oídio, deshidratación, sequía, calor, frío y tratamientos con ABA, y su participación en características de semillas, incluyendo germinación, contenido de ácido alfa-linolénico, contenido de aceite y semillas amarillas. Varios DEGs podrían estar regulados por BnaTT1. El ensayo de qRT-PCR validó la inducibilidad de dos DEGs sensibles al frío. Este estudio enriquecerá la comprensión sistemática de los genes de la familia y sentará una base molecular para la aplicación de genes en tolerancia al estrés, resistencia a enfermedades y mejora de la calidad en la colza.
Descripción
El dominio SH de RasAP (G3BP) es una familia de proteínas altamente conservada en organismos eucariotas que coordina la transducción de señales y la regulación génica post-transcripcional, y funciona en la formación de gránulos de estrés. Los G3BPs tienen roles importantes en el estrés abiótico/biótico en mamíferos, y investigaciones recientes sugieren que tienen funciones similares en plantas superiores. Esta familia contiene muchas semillas oleaginosas importantes, verduras y plantas ornamentales, pero no hay informes sobre la familia en especies. En este estudio, identificamos genes de la familia de seis especies del triángulo de U a nivel genómico. Luego analizamos su estructura génica, motivos proteicos, tipo de duplicación génica, filogenia, localización subcelular, loci SSR y miARNs ascendentes. Basándonos en datos de transcriptoma, analizamos los patrones de expresión de los genes en varios tejidos/órganos en respuesta a enfermedades, enfermedad del pie negro, oídio, deshidratación, sequía, calor, frío y tratamientos con ABA, y su participación en características de semillas, incluyendo germinación, contenido de ácido alfa-linolénico, contenido de aceite y semillas amarillas. Varios DEGs podrían estar regulados por BnaTT1. El ensayo de qRT-PCR validó la inducibilidad de dos DEGs sensibles al frío. Este estudio enriquecerá la comprensión sistemática de los genes de la familia y sentará una base molecular para la aplicación de genes en tolerancia al estrés, resistencia a enfermedades y mejora de la calidad en la colza.