Las proteasas aspárticas (APs) se encuentran entre las cuatro principales familias de enzimas proteolíticas presentes en las plantas, y son esenciales tanto para los mecanismos de respuesta al estrés como para las actividades de desarrollo. Aunque la familia de genes ha sido estudiada en plantas modelo, su caracterización en especies leñosas, particularmente en extremófitas, sigue siendo limitada. Además, la posible implicación de estos mecanismos en la tolerancia a la sal en los árboles aún no ha sido explorada. En esta investigación, se descubrieron 55 APs y se categorizaron en tres clases distintas basadas en sus estructuras proteicas conservadas. El análisis filogenético reveló funciones potenciales de genes derivados de diferentes especies. Nuestros hallazgos indican que esta familia posee un trasfondo evolutivo bien conservado y contiene numerosas regiones altamente variables, lo que la convierte en un excelente candidato para la identificación y el examen sistemático de árboles leñosos. Además, los motivos que se encuentran frecuentemente en las proteasas aspárticas dentro del genoma de estas especies pueden estar vinculados a funciones específicas. Parece que estos genes están asociados con funciones genéticas específicas. Estos genes están influenciados por elementos cis, que pueden desempeñar un papel en su capacidad de respuesta a fitohormonas, adaptación al estrés abiótico y señales de desarrollo. Nuestra investigación ofrece el primer análisis integral de la familia en estas especies, enfatizando sus funciones potenciales en la adaptación a condiciones de salinidad. Los hallazgos descubren candidatos para la ingeniería genética con el fin de mejorar la tolerancia a la sal en cultivos leñosos.