Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes en Pimiento () y Sus Perfiles de Expresión Durante la Germinación de Semillas
Autores: Zhao, Zhichao; Sun, Jingbo; Zhang, Feng; Dong, Chunjuan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Familia
Dormancia de semillas
Análisis a nivel genómico
Miembros de la familia de genes
Perfiles de expresión
Características de semillas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La familia () desempeña roles regulatorios clave en la dormancia y germinación de semillas. Sin embargo, no se ha realizado un análisis a nivel genómico de los genes para el pimiento (), una de las especies de importancia agrícola, y no se han llevado a cabo estudios para caracterizar sus perfiles de expresión. Basado en la información genómica, la identificación y análisis de expresión de los miembros de la familia de genes a través de enfoques bioinformáticos puede proporcionar una base teórica para estudios posteriores sobre las funciones biológicas y la mejora de las características de las semillas en la crianza. En este estudio, se identificaron un total de 13 genes en el genoma. El análisis filogenético mostró que estos CaDOG1s, junto con DOG1s de la berro de thale (), arroz () y maíz (), se clasificaron en cuatro subgrupos. Todos los genes estaban distribuidos de manera desigual en seis cromosomas y tenían patrones de exón-intrón relativamente conservados, la mayoría con cero a un intrón. Según los patrones de distribución cromosómica y el análisis de sinonimia de los genes, la familia se expandió principalmente a través de la replicación, que ocurrió predominantemente después de la divergencia de dicotiledóneas y monocotiledóneas. El análisis de motivos conservados indicó que todas las proteínas codificadas contenían el Motivo 2 y el Motivo 6, excepto CaDOG1-3. El análisis del perfil de expresión utilizando datos de transcriptoma reveló que los genes se expresaron de manera diferencial en varios tejidos y etapas de desarrollo, con una notable participación en flores y semillas. La PCR cuantitativa en tiempo real también reveló que todos los genes estaban regulados a la baja durante la germinación de semillas, lo que indica que pueden desempeñar roles negativos en la germinación de semillas. Además, tras el tratamiento con ácido abscísico, seis genes mostraron regulación al alza, mientras que en respuesta al etileno, cuatro genes mostraron regulación a la baja. En conjunto, estos hallazgos proporcionan una descripción extensa de la familia de genes y podrían facilitar estudios posteriores para elucidar sus funciones en la germinación de semillas.
Descripción
La familia () desempeña roles regulatorios clave en la dormancia y germinación de semillas. Sin embargo, no se ha realizado un análisis a nivel genómico de los genes para el pimiento (), una de las especies de importancia agrícola, y no se han llevado a cabo estudios para caracterizar sus perfiles de expresión. Basado en la información genómica, la identificación y análisis de expresión de los miembros de la familia de genes a través de enfoques bioinformáticos puede proporcionar una base teórica para estudios posteriores sobre las funciones biológicas y la mejora de las características de las semillas en la crianza. En este estudio, se identificaron un total de 13 genes en el genoma. El análisis filogenético mostró que estos CaDOG1s, junto con DOG1s de la berro de thale (), arroz () y maíz (), se clasificaron en cuatro subgrupos. Todos los genes estaban distribuidos de manera desigual en seis cromosomas y tenían patrones de exón-intrón relativamente conservados, la mayoría con cero a un intrón. Según los patrones de distribución cromosómica y el análisis de sinonimia de los genes, la familia se expandió principalmente a través de la replicación, que ocurrió predominantemente después de la divergencia de dicotiledóneas y monocotiledóneas. El análisis de motivos conservados indicó que todas las proteínas codificadas contenían el Motivo 2 y el Motivo 6, excepto CaDOG1-3. El análisis del perfil de expresión utilizando datos de transcriptoma reveló que los genes se expresaron de manera diferencial en varios tejidos y etapas de desarrollo, con una notable participación en flores y semillas. La PCR cuantitativa en tiempo real también reveló que todos los genes estaban regulados a la baja durante la germinación de semillas, lo que indica que pueden desempeñar roles negativos en la germinación de semillas. Además, tras el tratamiento con ácido abscísico, seis genes mostraron regulación al alza, mientras que en respuesta al etileno, cuatro genes mostraron regulación a la baja. En conjunto, estos hallazgos proporcionan una descripción extensa de la familia de genes y podrían facilitar estudios posteriores para elucidar sus funciones en la germinación de semillas.