Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes YABBY en Maíz y su Análisis de Expresión Bajo Estrés de Bajo Fósforo y Alto Nitrógeno
Autores: Li, Feiyan; Li, Shuang; Yi, Litao; Zhao, Pu; Ma, Chunhong; Huang, Xianting; Wang, Jiuguang; Liu, Chaoxian; Jiao, Bo; Mei, Xiupeng; Li, Chaofeng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factores de transcripción de yabby
Genoma de maíz
Estructuras génicas
Análisis filogenético
Análisis de elementos cis-regulatorios
Adaptación al estrés por nutrientes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
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Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción YABBY (TFs) son reguladores clave involucrados en diversos aspectos del crecimiento de las plantas, la organogénesis y la adaptación a estrés ambiental. Sin embargo, las características funcionales de los TFs YABBY en el maíz siguen siendo en gran medida inexploradas. En este estudio, identificamos sistemáticamente 12 genes en el genoma del maíz y caracterizamos sus estructuras génicas, propiedades fisicoquímicas, ubicación cromosómica y colinealidad genómica. El análisis filogenético clasificó estos genes en cinco subfamilias, con miembros de cada subfamilia exhibiendo estructuras de exón-intrón y composiciones de motivos altamente conservadas, lo que indica una posible conservación funcional dentro de las subfamilias. El análisis de elementos cis-regulatorios indicó que los genes pueden estar involucrados en procesos de desarrollo, respuestas a estrés abiótico y vías de señalización mediadas por la luz. Además, la secuenciación del transcriptoma combinada con la validación por qRT-PCR demostró que varios genes, incluidos , , , y , son sensibles a condiciones de bajo fósforo y alto nitrógeno, lo que implica sus posibles roles en la adaptación al estrés por nutrientes. Vale la pena mencionar que este estudio redefinió la composición de la familia de genes YABBY del maíz al excluir un miembro previamente anotado y, por primera vez, estableció un vínculo entre los factores de transcripción YABBY y las respuestas al estrés por nutrientes. Mientras tanto, esta también es la primera vez que se han realizado análisis de estructura de proteínas, análisis de elementos cis-regulatorios, análisis de colinealidad interespecífica y localización subcelular en la familia de genes ZmYABBY del maíz. En resumen, nuestro estudio proporciona valiosos recursos génicos para la mejora molecular del maíz y ofrece nuevas perspectivas sobre las funciones de los TFs YABBY.
Descripción
Los factores de transcripción YABBY (TFs) son reguladores clave involucrados en diversos aspectos del crecimiento de las plantas, la organogénesis y la adaptación a estrés ambiental. Sin embargo, las características funcionales de los TFs YABBY en el maíz siguen siendo en gran medida inexploradas. En este estudio, identificamos sistemáticamente 12 genes en el genoma del maíz y caracterizamos sus estructuras génicas, propiedades fisicoquímicas, ubicación cromosómica y colinealidad genómica. El análisis filogenético clasificó estos genes en cinco subfamilias, con miembros de cada subfamilia exhibiendo estructuras de exón-intrón y composiciones de motivos altamente conservadas, lo que indica una posible conservación funcional dentro de las subfamilias. El análisis de elementos cis-regulatorios indicó que los genes pueden estar involucrados en procesos de desarrollo, respuestas a estrés abiótico y vías de señalización mediadas por la luz. Además, la secuenciación del transcriptoma combinada con la validación por qRT-PCR demostró que varios genes, incluidos , , , y , son sensibles a condiciones de bajo fósforo y alto nitrógeno, lo que implica sus posibles roles en la adaptación al estrés por nutrientes. Vale la pena mencionar que este estudio redefinió la composición de la familia de genes YABBY del maíz al excluir un miembro previamente anotado y, por primera vez, estableció un vínculo entre los factores de transcripción YABBY y las respuestas al estrés por nutrientes. Mientras tanto, esta también es la primera vez que se han realizado análisis de estructura de proteínas, análisis de elementos cis-regulatorios, análisis de colinealidad interespecífica y localización subcelular en la familia de genes ZmYABBY del maíz. En resumen, nuestro estudio proporciona valiosos recursos génicos para la mejora molecular del maíz y ofrece nuevas perspectivas sobre las funciones de los TFs YABBY.