Identificación y Análisis Filogenético de la Subfamilia en
Autores: Luo, Dingfan; Mei, Desheng; Wei, Wenliang; Liu, Jia
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
R2r3-myb
Genes
Estrés por sequía
Elementos cis
Relaciones evolutivas
Regulación ascendente
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
Las proteínas de la subfamilia R2R3-MYB están compuestas por la mayoría de los miembros de la proteína MYB (homólogo viral del oncogén aviar v-Myb), un factor de transcripción (TF) específico de las plantas que se clasifica en cuatro clases dependiendo del número de repeticiones de MYB. Los TF R2R3-MYB están involucrados en procesos fisiológicos y bioquímicos. Sin embargo, las funciones de los genes aún son principalmente desconocidas. En este estudio, se seleccionaron 35 genes en el genoma de , y se descubrieron detalles sobre sus características físicas y químicas, relaciones evolutivas, ubicaciones cromosómicas, estructuras genéticas, estructuras proteicas tridimensionales, elementos promotores cis-actuantes y duplicaciones génicas. Según estudios evolutivos, los genes han experimentado duplicaciones segmentarias y presión de selección positiva. Las mismas subfamilias tienen patrones de intrones-exones y motivos similares, de acuerdo con la estructura de los genes y los motivos conservados. Además, a través del análisis de elementos cis, se han encontrado muchos elementos cis-responsivos a la sequía y otros elementos cis-responsivos al estrés en las regiones promotoras de los genes. La expresión del gen muestra una variedad de patrones específicos de tejido. Se eligieron diez genes relacionados con la lignina para el tratamiento de sequía. Nuestra investigación seleccionó cuatro genes que mostraron una regulación positiva significativa bajo estrés por sequía, y por lo tanto pueden ser genes importantes responsivos a la sequía. Los hallazgos establecen una nueva base para comprender los complejos mecanismos en múltiples etapas de desarrollo y vías relacionadas con el estrés por sequía en la colza.
Descripción
Las proteínas de la subfamilia R2R3-MYB están compuestas por la mayoría de los miembros de la proteína MYB (homólogo viral del oncogén aviar v-Myb), un factor de transcripción (TF) específico de las plantas que se clasifica en cuatro clases dependiendo del número de repeticiones de MYB. Los TF R2R3-MYB están involucrados en procesos fisiológicos y bioquímicos. Sin embargo, las funciones de los genes aún son principalmente desconocidas. En este estudio, se seleccionaron 35 genes en el genoma de , y se descubrieron detalles sobre sus características físicas y químicas, relaciones evolutivas, ubicaciones cromosómicas, estructuras genéticas, estructuras proteicas tridimensionales, elementos promotores cis-actuantes y duplicaciones génicas. Según estudios evolutivos, los genes han experimentado duplicaciones segmentarias y presión de selección positiva. Las mismas subfamilias tienen patrones de intrones-exones y motivos similares, de acuerdo con la estructura de los genes y los motivos conservados. Además, a través del análisis de elementos cis, se han encontrado muchos elementos cis-responsivos a la sequía y otros elementos cis-responsivos al estrés en las regiones promotoras de los genes. La expresión del gen muestra una variedad de patrones específicos de tejido. Se eligieron diez genes relacionados con la lignina para el tratamiento de sequía. Nuestra investigación seleccionó cuatro genes que mostraron una regulación positiva significativa bajo estrés por sequía, y por lo tanto pueden ser genes importantes responsivos a la sequía. Los hallazgos establecen una nueva base para comprender los complejos mecanismos en múltiples etapas de desarrollo y vías relacionadas con el estrés por sequía en la colza.