Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión de la Familia de Genes de Proteínas Similares a la Membrana del Dominio de la Estría de Caspary en Cacahuate (L.) Reveló Su Papel Crucial en el Crecimiento y la Tolerancia a Múltiples Estrés
Autores: Su, Yating; Fang, Jieyun; Zeeshan Ul Haq, Muhammad; Yang, Wanli; Yu, Jing; Yang, Dongmei; Liu, Ya; Wu, Yougen
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Proteínas de dominio de la membrana de la franja de Caspar
Franjas de Caspar
Cacahuetes cultivados
Familia de genes
Bioinformática
Resistencia al estrés
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
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Citaciones: Sin citaciones
Las proteínas de dominio de la membrana de la franja de Caspary (CASPs), que regulan la formación de franjas de Caspary en las plantas, cumplen funciones cruciales en la facilitación del crecimiento, desarrollo y resistencia de las plantas al estrés abiótico. Sin embargo, se ha investigado poco sobre las características y funciones de estas en los cacahuetes cultivados. En este estudio, se realizó la identificación a nivel genómico y el análisis de expresión de la familia de genes utilizando datos de bioinformática y transcriptómica. Los resultados mostraron que se identificaron un total de 80 miembros en 20 cromosomas, que se dividieron en tres subclústeres, los cuales se localizaron principalmente en la membrana celular. El análisis Ka/Ks reveló que la mayoría de los genes sufrieron selección purificadora. El análisis de elementos sugirió la posible participación de estos en respuestas hormonales y de estrés, incluyendo GA, MeJA, IAA, ABA, sequía y baja temperatura. Además, se identificaron 20 miARN diferentes para 37 genes diferentes mediante el servicio psRNATarget. Asimismo, el análisis transcripcional reveló genes clave que responden a varios estreses, procesamiento hormonal y tipos de tejidos, incluyendo 33 genes en estrés por baja temperatura y sequía y 41 genes en expresión específica de tejidos. Estos resultados proporcionan una base teórica importante para las funciones de estos en el crecimiento, desarrollo y resistencia a múltiples estreses en los cacahuetes cultivados.
Descripción
Las proteínas de dominio de la membrana de la franja de Caspary (CASPs), que regulan la formación de franjas de Caspary en las plantas, cumplen funciones cruciales en la facilitación del crecimiento, desarrollo y resistencia de las plantas al estrés abiótico. Sin embargo, se ha investigado poco sobre las características y funciones de estas en los cacahuetes cultivados. En este estudio, se realizó la identificación a nivel genómico y el análisis de expresión de la familia de genes utilizando datos de bioinformática y transcriptómica. Los resultados mostraron que se identificaron un total de 80 miembros en 20 cromosomas, que se dividieron en tres subclústeres, los cuales se localizaron principalmente en la membrana celular. El análisis Ka/Ks reveló que la mayoría de los genes sufrieron selección purificadora. El análisis de elementos sugirió la posible participación de estos en respuestas hormonales y de estrés, incluyendo GA, MeJA, IAA, ABA, sequía y baja temperatura. Además, se identificaron 20 miARN diferentes para 37 genes diferentes mediante el servicio psRNATarget. Asimismo, el análisis transcripcional reveló genes clave que responden a varios estreses, procesamiento hormonal y tipos de tejidos, incluyendo 33 genes en estrés por baja temperatura y sequía y 41 genes en expresión específica de tejidos. Estos resultados proporcionan una base teórica importante para las funciones de estos en el crecimiento, desarrollo y resistencia a múltiples estreses en los cacahuetes cultivados.