Objetivo: Este estudio evaluó cómo las especies de zooplancton se distribuyen en cinco charcas con diferentes hidroperíodos en el Parque Nacional Restinga de Jurubatiba y la importancia del tiempo de retención del agua para la diversidad taxonómica y funcional de esta comunidad.

Métodos: Se evaluó indirectamente el tiempo de retención del agua mediante mediciones diarias de temperatura durante tres años y se analizaron los principales parámetros limnológicos. La comunidad de zooplancton se muestreó en las cinco charcas y su diversidad se evaluó mediante riqueza de especies (S), índice de diversidad de Shannon-Wiener (H’), riqueza funcional (FRic), divergencia funcional (FDiv) y dispersión funcional (FDis).

Resultados: Aunque las charcas forman parte del mismo mosaico natural, presentan características distintas. Factores abióticos como la salinidad del agua y un hidroperíodo más inestable afectaron negativamente la diversidad taxonómica y funcional del zooplancton. Los valores más altos de diversidad taxonómica se registraron en charcas con condiciones intermedias de retención de agua (sequías estacionales).

Conclusiones: Los ambientes estacionales favorecen la co-ocurrencia de especies de charcas perennes y efímeras, mostrando mayores valores de H’, FRic y FDiv cuando se analiza de manera integrada. Asimismo, se observó que, aun bajo el mismo pool regional de especies, las diferencias en la frecuencia de desecación fueron suficientes para determinar variaciones en la comunidad de zooplancton.