Las alteraciones del uso del suelo y la escorrentía de pesticidas se encuentran entre las principales causas de deterioro en las zonas agrícolas. Evaluamos la influencia de diferentes usos del suelo (bosque, pastizales y agricultura intensiva) en la calidad del agua y en los ensambles bentónicos de macroinvertebrados en tres ocasiones: en la estación seca, en la estación lluviosa y al final de la estación lluviosa. Los macroinvertebrados respondieron a este gradiente de deterioro: los sitios agrícolas presentaron una riqueza significativamente menor que los sitios forestados y de pastizales, y todos los principales grupos de invertebrados se vieron significativamente afectados. La mayoría de los taxones encontrados en sitios forestados se encontraron en sitios de pastizales, pero a menudo con densidades más bajas. En este caso, la pérdida de hábitats debido a la sedimentación y la menor complejidad de los sustratos parecen ser la fuerza disruptiva para la fauna de macroinvertebrados.