La enzima transcriptasa inversa (RT) del VIH-1 es un objetivo principal para el desarrollo de fármacos antivirales, con más de la mitad de los tratamientos aprobados por la FDA contra la infección por VIH que apuntan a la actividad de la ADN polimerasa de esta enzima. La RT del VIH-1 es una enzima multifuncional que tiene actividad de polimerasa dependiente de ARN y ADN, junto con actividad de ribonucleasa H (RNasa H). Esta última es responsable de la degradación de la plantilla de ARN genómico viral durante la síntesis de la primera cadena de ADN para permitir la finalización de la transcripción inversa y el ADN bicatenario viral. Si bien se ha demostrado que la actividad de RNasa H de la RT es esencial para la infectividad del virus, todos los fármacos actualmente utilizados dirigidos a la RT inhiben la actividad de polimerasa de la enzima; ninguno apunta a la RNasa H. En la última década, la creciente prevalencia de variantes de VIH resistentes a antirretrovirales utilizados clínicamente ha estimulado la búsqueda de inhibidores dirigidos a etapas de la replicación del VIH diferentes a las que apuntan los fármacos actuales. La RNasa H del VIH es un objetivo novedoso y, en los últimos años, se ha avanzado significativamente en la identificación y caracterización de nuevos farmacóforos inhibidores de RNasa H. En esta revisión nos centramos principalmente en los compuestos más potentes de baja potencia micromolar, ya que estos proporcionan bases lógicas para un desarrollo posterior. También discutimos por qué la RNasa H del VIH ha sido un objetivo difícil para el desarrollo de fármacos antirretrovirales.