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La integración de firmas de selección e interacciones proteicas revela, , y como los genes candidatos prometedores que subyacen a las características del cerdo negro Licha

Autores: Xie, Qinqin; Zhang, Zhenyang; Chen, Zitao; Sun, Jiabao; Li, Meng; Wang, Qishan; Pan, Yuchun

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 12

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El cerdo Licha negro (LI) tiene características específicas de mayor longitud corporal y adecuada deposición de grasa entre los cerdos indígenas chinos. La longitud corporal es uno de los rasgos externos que afectan el rendimiento de producción, y la deposición de grasa influye en la calidad de la carne. Sin embargo, las características genéticas de los cerdos LI aún no se han descubierto de manera sistemática. Aquí, se utilizó la información genómica de 891 individuos de cerdos LI, cerdos comerciales y otros cerdos indígenas chinos para analizar las características de la raza del cerdo LI con corridas de homocigosidad, haplotipos y firmas de selección. Los resultados mostraron que los genes relacionados con rasgos de crecimiento (es decir, y ) y el gen relacionado con rasgos de gordura (es decir, ) eran los genes candidatos prometedores que estaban estrechamente relacionados con las características de los cerdos LI. Además, la red de interacción proteína-proteína reveló las interacciones potenciales entre los genes candidatos prometedores y el gen. Los datos de expresión de ARN de FarmGTEx indicaron que los niveles de expresión de ARN de , , , y estaban altamente correlacionados en el íleon. Este estudio proporciona valiosos conocimientos moleculares sobre los mecanismos que afectan la longitud corporal y la deposición de grasa en los cerdos, que pueden ser utilizados en el proceso de cría posterior para mejorar la calidad de la carne y la rentabilidad comercial.

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