La colocación de ha sido durante mucho tiempo controvertida, ya que sus rasgos morfológicos intermedios difuminan la frontera entre y . Para abordar este desafío, adoptamos un enfoque quimiotaxonómico, integrando los contenidos de flavonoides con indicadores ecológicos, como una línea de evidencia independiente que complementa los datos morfológicos y moleculares. Utilizando UPLC-UV, se cuantificaron seis flavonoides de 16 poblaciones coreanas que representan seis taxones. Los análisis multivariantes distinguieron claramente y , con y formando clados estrechamente relacionados pero separados. Factores ecológicos como la precipitación y la apertura del dosel afectaron significativamente los niveles de flavonoides, particularmente el luteolín 7--glucósido y el yuankanin. Sin embargo, las huellas dactilares de flavonoides diagnósticos se mantuvieron consistentes en todos los hábitats. Este estudio demuestra que integrar perspectivas químicas y ambientales puede fortalecer los marcos taxonómicos y apoyar tanto la clasificación como la evidencia quimiotaxonómica en Thymelaeaceae, ofreciendo una base metodológica para futuros estudios comparativos entre familias de plantas relacionadas.