Análisis transcriptómico comparativo revela la interacción del metabolismo de azúcares y hormonas involucrado en la morfogénesis de pelos radiculares del abeto en peligro de extinción
Autores: Liu, Bin; Liu, Ke; Chen, Xiaorong; Xiao, Duohong; Wang, Tingjin; Yang, Yang; Shuai, Hui; Wu, Sumei; Yuan, Lu; Chen, Liping
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Extremadamente raro
En peligro crítico de extinción
Dependiente de micorrizas
Morfogénesis de pelos radiculares
Análisis del transcriptoma
Mecanismo de supervivencia
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
una planta extremadamente rara y en peligro crítico de extinción con solo tres árboles adultos silvestres en todo el mundo, es altamente dependiente de la micorriza, lo que genera dificultades en su protección y reproducción artificial sin simbiosis. La morfogénesis de los pelos radiculares juega un papel importante en la supervivencia de los simbiontes micorrízicos. Debido a la falta de un genoma y transcriptoma efectivos de, las señales moleculares involucradas en el desarrollo de los pelos radiculares permanecen desconocidas, lo que obstaculiza el análisis de su mecanismo de extinción y protección. En este trabajo, se establecieron principalmente transcriptomas de radículas con pelos radiculares (RH1) y sin pelos radiculares (RH0) de plantones in vitro. La anotación funcional y el análisis de genes expresados diferencialmente (DEG) mostraron que los dos fenotipos tienen grupos de genes expresados diferencialmente altamente diferentes. La divergencia del transcriptoma identificó señales hormonales y de azúcares involucradas principalmente en la morfogénesis de los pelos radiculares de. El análisis de red de correlación ponderada (WGCNA) junto con PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) encontró que dos módulos de hormona-sacarosa-pelo radicular estaban vinculados por, y se posicionó en el centro de la red de regulación, coexpresado con en la transducción hormonal y genes clave relacionados con la morfogénesis de los pelos radiculares. Nuestros resultados contribuyen a una mejor comprensión de los mecanismos moleculares del desarrollo de los pelos radiculares y ofrecen nuevas perspectivas para descifrar el mecanismo de supervivencia de y otras especies en peligro, utilizando los pelos radiculares como una estrategia compensatoria en lugar de un crecimiento micorrízico deficiente.
Descripción
una planta extremadamente rara y en peligro crítico de extinción con solo tres árboles adultos silvestres en todo el mundo, es altamente dependiente de la micorriza, lo que genera dificultades en su protección y reproducción artificial sin simbiosis. La morfogénesis de los pelos radiculares juega un papel importante en la supervivencia de los simbiontes micorrízicos. Debido a la falta de un genoma y transcriptoma efectivos de, las señales moleculares involucradas en el desarrollo de los pelos radiculares permanecen desconocidas, lo que obstaculiza el análisis de su mecanismo de extinción y protección. En este trabajo, se establecieron principalmente transcriptomas de radículas con pelos radiculares (RH1) y sin pelos radiculares (RH0) de plantones in vitro. La anotación funcional y el análisis de genes expresados diferencialmente (DEG) mostraron que los dos fenotipos tienen grupos de genes expresados diferencialmente altamente diferentes. La divergencia del transcriptoma identificó señales hormonales y de azúcares involucradas principalmente en la morfogénesis de los pelos radiculares de. El análisis de red de correlación ponderada (WGCNA) junto con PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) encontró que dos módulos de hormona-sacarosa-pelo radicular estaban vinculados por, y se posicionó en el centro de la red de regulación, coexpresado con en la transducción hormonal y genes clave relacionados con la morfogénesis de los pelos radiculares. Nuestros resultados contribuyen a una mejor comprensión de los mecanismos moleculares del desarrollo de los pelos radiculares y ofrecen nuevas perspectivas para descifrar el mecanismo de supervivencia de y otras especies en peligro, utilizando los pelos radiculares como una estrategia compensatoria en lugar de un crecimiento micorrízico deficiente.