Los ecosistemas de manglares pueden ser tanto fuentes como sumideros significativos de gases de efecto invernadero. La restauración de los bosques de manglares se utiliza cada vez más como una herramienta natural para mitigar el cambio climático. Sin embargo, las estimaciones de los intercambios de carbono siguen siendo poco claras, especialmente en los manglares restaurados. En este estudio, observamos las variaciones temporales en los flujos de dióxido de carbono (CO) y metano (CH) y sus controles biofísicos durante 4 años, basándonos en un sistema de covarianza de eddy de camino cerrado (EC). Las mediciones se realizaron en un parque de humedales de manglares con manglares restaurados de 14 años rodeados de aguas abiertas en la provincia de Guangdong, China. Las mediciones de EC mostraron que el ecosistema de manglares actuó como una fuente de CO con un intercambio neto de ecosistema de CO (NEE) de 305 g C m desde enero de 2019 hasta mayo de 2020 mediante la medición de la torre de 5 m. Después de que la torre se ajustó a 10 m, el manglar mostró un sumidero de CO con un NEE de -345 g C m desde junio de 2020 hasta diciembre de 2022. El cambio en la altura de la torre influyó en la interpretación de las tendencias interanuales en el NEE. No hubo tendencias interanuales significativas en la productividad primaria bruta (GPP) y los valores de respiración del ecosistema (Re). El cambio de fuente de CO a sumidero puede atribuirse a la disminución de la proporción de superficie terrestre por el reemplazo de la torre, lo que reduce la proporción de la respiración del dosel de manglares y, por lo tanto, captura flujos de CO más bajos de las aguas abiertas. Los manglares restaurados indicaron fuentes fuertes de CH de 23.2-26.3 g C m a. Según el análisis de bosque aleatorio, la proporción de superficie terrestre, la radiación y la humedad relativa fueron los tres predictores más importantes del NEE, mientras que el flujo de CH fue más sensible a la temperatura del aire. En comparación con los manglares naturales y los manglares restaurados a largo plazo, este manglar restaurado de 14 años aún no había alcanzado una capacidad máxima de secuestro de carbono. Nuestro estudio destaca la necesidad de un diseño cuidadoso de observaciones a largo plazo de los manglares restaurados y propone necesidades futuras en el contexto de la neutralidad de carbono.