La expresión de los genes relacionados con el complejo remodelador de la cromatina SWI/SNF se asocia con la infiltración inmunitaria y el pronóstico en el cáncer de pulmón
Autores: Zheng, Ying; Zhou, Rong; Yu, Qin-hua; Hu, Dan; Wu, Jie
Idioma: Inglés
Editor: Maja Herak Bosnar
Año: 2024
Acceso abierto
Categoría
Licencia
Consultas: 39
Citaciones: Periodicum Biologorum Vol. 126 Núm. 1-2
Antecedentes y propósito: El adenocarcinoma pulmonar (LUAD) es el tipo más común de cáncer de pulmón con un pronóstico desfavorable. El complejo de remodelado de cromatina switch de tipo de apareamiento/sucrosa no fermentadora (SWI/SNF) (SCRC) está involucrado en la aparición y progresión del LUAD. Este estudio tuvo como objetivo investigar la relación entre los genes relacionados con SCRC (SCRCRGs) y el pronóstico del cáncer de pulmón.
Materiales y métodos: Se obtuvieron los datos de secuenciación de ARN y los datos clínicos correspondientes de pacientes diagnosticados con LUAD de la base de datos The Cancer Genome Atlas. Se realizó un análisis jerárquico de la expresión de 31 genes en 510 muestras de LUAD y 56 muestras de tejido paracanceroso para distinguir a los pacientes según los perfiles de expresión. Se evaluaron los roles pronósticos de los SCRCRGs. Los factores pronósticos identificados fueron integrados para investigar la probabilidad de supervivencia general (OS) en LUAD.
Resultados: No se observaron diferencias en la OS, la supervivencia estable de la enfermedad, la supervivencia libre de enfermedad ni la supervivencia libre de progresión entre los subgrupos de LUAD; sin embargo, el período de supervivencia media del Cluster_3 fue más largo que el de los otros clústeres. Se identificaron un total de 29 genes con diferencias significativas entre subgrupos. Se notaron diferencias significativas en la expresión de los SCRCRGs, particularmente SMARCA2, WDR77 y SMARCB1, entre los tejidos cancerosos y adyacentes. Tras un análisis de regresión utilizando el método Lasso-Cox, se obtuvo un modelo de cinco genes que podría predecir el pronóstico del LUAD.
Conclusiones: En LUAD, las diferencias en el perfil de expresión de los SCRCRGs estuvieron relacionadas con el pronóstico y la infiltración inmune. SMARCA2 puede ser aprovechado como un posible objetivo para la inmunoterapia.
Antecedentes y propósito: El adenocarcinoma pulmonar (LUAD) es el tipo más común de cáncer de pulmón con un pronóstico desfavorable. El complejo de remodelado de cromatina switch de tipo de apareamiento/sucrosa no fermentadora (SWI/SNF) (SCRC) está involucrado en la aparición y progresión del LUAD. Este estudio tuvo como objetivo investigar la relación entre los genes relacionados con SCRC (SCRCRGs) y el pronóstico del cáncer de pulmón.
Materiales y métodos: Se obtuvieron los datos de secuenciación de ARN y los datos clínicos correspondientes de pacientes diagnosticados con LUAD de la base de datos The Cancer Genome Atlas. Se realizó un análisis jerárquico de la expresión de 31 genes en 510 muestras de LUAD y 56 muestras de tejido paracanceroso para distinguir a los pacientes según los perfiles de expresión. Se evaluaron los roles pronósticos de los SCRCRGs. Los factores pronósticos identificados fueron integrados para investigar la probabilidad de supervivencia general (OS) en LUAD.
Resultados: No se observaron diferencias en la OS, la supervivencia estable de la enfermedad, la supervivencia libre de enfermedad ni la supervivencia libre de progresión entre los subgrupos de LUAD; sin embargo, el período de supervivencia media del Cluster_3 fue más largo que el de los otros clústeres. Se identificaron un total de 29 genes con diferencias significativas entre subgrupos. Se notaron diferencias significativas en la expresión de los SCRCRGs, particularmente SMARCA2, WDR77 y SMARCB1, entre los tejidos cancerosos y adyacentes. Tras un análisis de regresión utilizando el método Lasso-Cox, se obtuvo un modelo de cinco genes que podría predecir el pronóstico del LUAD.
Conclusiones: En LUAD, las diferencias en el perfil de expresión de los SCRCRGs estuvieron relacionadas con el pronóstico y la infiltración inmune. SMARCA2 puede ser aprovechado como un posible objetivo para la inmunoterapia.