Los murciélagos son hospedadores naturales de numerosos patógenos, y el estudio de los murciélagos que portan patógenos sin desarrollar enfermedades ayuda a profundizar nuestra comprensión de la relación entre la inmunidad y las enfermedades infecciosas. Los hábitos específicos de los murciélagos y la falta de reactivos específicos han limitado los estudios relacionados con la inmunidad de los murciélagos, mientras que los estudios existentes sobre la inmunidad de los murciélagos han descuidado el papel de la microbiota intestinal en la modulación de la inmunidad. En este estudio, primero tratamos a ratones C57BL/6 libres de patógenos específicos (SPF) con una solución antibiótica compleja durante 7 días consecutivos para obtener ratones pseudo-estériles y luego trasplantamos la microbiota intestinal de murciélagos en los ratones a través del trasplante de microbiota fecal (FMT), eludiendo así el dilema de estudiar la microbiota intestinal de la vida silvestre. Los resultados mostraron que en los días 7 y 14 después del FMT, la microbiota intestinal del murciélago de herradura mayor, un murciélago insectívoro de amplia distribución, podía regular las células inmunitarias en los ratones, que exhibieron una rápida respuesta inmune innata. Este resultado mejora nuestra comprensión del sistema inmunológico único de los murciélagos y enfatiza la importancia de la microbiota intestinal de los murciélagos en la inmunidad.