Los circARNs constituyen una nueva clase de ARN, generalmente considerados como ARN no codificantes; no obstante, su potencial de codificación ha sido objeto de escrutinio. En este trabajo, exploramos sistemáticamente las proteínas predichas de más de 160,000 circARNs detectados mediante secuenciación de ARN por captura de exoma y recopilados en el compendio pan-cáncer MiOncoCirc, incluyendo muestras normales y cancerosas de diferentes tipos de tejidos. Para la evaluación funcional, comparamos su estructura primaria y composición de dominios con las derivadas de los mismos ARN mensajeros lineales. Entre los 4362 circARNs que potencialmente codifican proteínas con una estructura primaria única y 1179 que codifican proteínas con una composición de dominio novedosa, 183 se expresaron diferencialmente en cáncer. En particular, ocho estaban asociados con el pronóstico en leucemia mieloide aguda. La clasificación funcional de los polipéptidos codificados por circARNs desregulados mostró un enriquecimiento en la señalización de hemo y cáncer, procesos de unión al ADN y fosforilación, y reveló los roles de algunos efectores basados en circARN en el cáncer.