El conocimiento de los factores limnológicos abióticos es importante para monitorear los cambios causados ​​por el ser humano y explicar la estructura y dinámica de poblaciones y comunidades en diversos ecosistemas de aguas continentales. En este estudio, utilizamos un conjunto de datos a largo plazo (ocho años) recopilados en 10 hábitats con diferentes características (cauces fluviales y lagos conectados y aislados) para describir los patrones espaciales y temporales de algunos de los principales factores limnológicos. En general, el grado de conectividad de los lagos, junto con los ríos a los que se conectan, fueron determinantes importantes de sus características limnológicas. Estas diferencias son previsibles, ya que los ríos que desembocan en la llanura aluvial provienen de diferentes regiones geológicas y están sujetos a diferentes impactos humanos. A gran escala espacial, estas diferencias contribuyen al aumento de la diversidad de hábitats de la llanura aluvial y, por lo tanto, a su alta biodiversidad. En cuanto a la variación temporal, la transparencia del disco de Secchi aumentó y el fósforo total disminuyó en el cauce principal del río Paraná durante los últimos 20 años. Si bien estos cambios se atribuyen directamente a las diversas cascadas de los embalses ubicados aguas arriba, el cierre de la presa de Porto Primavera en 1998 potenció este efecto. El aumento de la transparencia del agua explica los cambios bióticos en la llanura aluvial. El agua del río Paraná, con menor contenido de fósforo, probablemente diluye las concentraciones de este elemento en los cuerpos de agua de la llanura aluvial durante las grandes inundaciones, con consecuencias futuras para su productividad.