Estimar el efecto de aptitud conferido por un transgen introducido en poblaciones de especies parientes silvestres de un cultivo genéticamente modificado (GM) juega un papel importante en la evaluación de los posibles riesgos ambientales causados por el flujo de transgenes. Tal estimación se ha centrado esencialmente en las características relacionadas con la supervivencia y la fecundidad medidas por encima del suelo, pero con poca atención al destino de las semillas GM que se rompen en los bancos de semillas del suelo después de la maduración. Para explorar la supervivencia y longevidad de las semillas GM en el suelo, examinamos los comportamientos de germinación de semillas híbridas de cultivo-silvestre (F-F) de las líneas de un arroz tolerante a herbicidas GM que contiene un transgen endógeno hibridado con dos poblaciones silvestres después de que las semillas fueron enterradas en el suelo. Los resultados mostraron un aumento significativo en la germinación de las semillas híbridas de cultivo-silvestre GM después del entierro en el suelo, en comparación con las semillas híbridas no GM. Además, la proporción de semillas dormantes y el contenido de la hormona de crecimiento auxina (ácido indol-3-acético, IAA) en las semillas híbridas de cultivo-silvestre GM aumentaron significativamente. Evidentemente, el transgen mejora la supervivencia y longevidad de las semillas de arroz híbridas GM en los bancos de semillas del suelo. La mayor supervivencia y longevidad de las semillas híbridas GM está probablemente asociada con el aumento en la dormancia de las semillas y la auxina (IAA) al sobreexpresar el transgen endógeno del arroz. Por lo tanto, el destino de las semillas GM en los bancos de semillas del suelo debe ser considerado seriamente al evaluar los riesgos ambientales causados por el flujo de transgenes.