Los suelos urbanos están sujetos a una intensa perturbación antropogénica, lo que a menudo resulta en la pérdida de biodiversidad y una reducción de la funcionalidad del ecosistema. Sin embargo, las comunidades microbianas rizosféricas ayudan a mantener servicios críticos del ecosistema del suelo, apoyando la resiliencia del suelo urbano. Este estudio evaluó la diversidad de bacterias cultivables asociadas con las rizosferas y en áreas verdes de Medellín, Colombia, bajo niveles contrastantes de presiones antrópicas. Se muestrearon suelos rizosféricos y no rizosféricos cerca de sitios de mecánica automotriz, y se evaluaron las comunidades bacterianas a través de conteo en placa y caracterización morfológica. Se aplicaron índices de diversidad alfa, beta y de rarefacción para evaluar los morfotipos cultivables. Se apoyó un microbioma rizosférico más diverso y complejo, particularmente en suelos no expuestos, mientras que se alojaron comunidades menos diversas bajo condiciones similares. Los índices de diversidad distinguieron efectivamente los patrones microbianos, demostrando la utilidad de los métodos basados en cultivos para la evaluación de comunidades microbianas. Como primer paso en los flujos de trabajo de bioprospección microbiana, estos métodos permiten la evaluación rápida de la diversidad cultivable y apoyan la toma de decisiones para la selección de entornos prometedores, especies de plantas y aislamientos microbianos. Este enfoque puede informar sobre las amenazas al suelo urbano, la promoción de interacciones beneficiosas entre plantas y microbios, y la identificación de especies bioindicadoras para el monitoreo de la salud del suelo en un marco para la gestión de áreas verdes.