El flujo genético de los parientes silvestres de L. a los cultivos hortícolas ha ocurrido y continúa ocurriendo de manera ordinaria en varios países mediterráneos, como Sicilia, representando un importante punto caliente de diversidad para algunos de ellos, como el brócoli, la coliflor y la col rizada. Para detectar y explotar los alelos olvidados perdidos durante los procesos de domesticación de los cultivos, se ha prestado atención a la individuación de marcadores específicos para identificar genotipos caracterizados por rasgos de inflorescencia hipertrófica mediante la selección asistida por marcadores (MAS) durante las primeras fases de crecimiento de las plantas después de los cruces entre brócoli (var.)/coliflor (var.) con parientes silvestres (n = 9), reduciendo los costos de cultivo y evaluación. Los rasgos deseados que a menudo se encuentran en varios parientes silvestres están principalmente dirigidos a mejorar la resistencia de la planta a estreses bióticos y abióticos y a aumentar los rasgos organolépticos, nutritivos y nutracéuticos de los productos. Uno de los rasgos objetivo para la mejora del brócoli y la coliflor está representado por el tamaño de las inflorescencias, como se documenta en los procesos de domesticación de estos dos cultivos. Basado en los resultados previos alcanzados, la matriz numérica, obtenida utilizando cinco repeticiones de secuencia simple (SSRs), fue analizada para evaluar la relación entre las principales características morfométricas de las inflorescencias y la variación alélica de los loci de SSRs analizados (BoABI1, BoAP1, BoPLD1, BoTHL1 y PBCGSSRBo39), tanto para los parientes silvestres (n = 9) como para el conjunto de accesiones. Las principales características morfométricas de las inflorescencias, como peso, altura, diámetro, forma, ángulo de curvatura de la inflorescencia y su diámetro de tallo, fueron registradas antes de la antésis de la flor. Analizamos las correlaciones entre la variación alélica de los primers de SSRs utilizados y las características morfométricas de las inflorescencias para individuar regiones genómicas que estimulan la hipertrofia del órgano reproductivo. Las relaciones encontradas explican la diversidad entre cultivos y las especies complejas (n = 9) en cuanto al tamaño y la estructura de las inflorescencias. Los marcadores individuados permiten una importante reducción de tiempo durante los programas de mejora después de cruzar especies silvestres para transferir resistencias bióticas y abióticas útiles, así como rasgos organolépticos y nutracéuticos a los cultivos mediante MAS.