es una alga modelo de creciente interés como fábrica celular para la producción de compuestos valiosos, incluidos proteínas terapéuticas y metabolitos bioactivos. La expresión de genes extraños en el cloroplasto es particularmente ventajosa ya que: (i) la acumulación de producto en este compartimento subcelular minimiza la toxicidad potencial para el resto de la célula; (ii) los genes pueden integrarse en loci específicos del genoma del cloroplasto (plastoma) mediante recombinación homóloga; (iii) la alta ploidía del plastoma y la alta expresión de genes del cloroplasto pueden aprovecharse para alcanzar niveles de proteína recombinante de hasta el 5% de la proteína total de la célula; (iv) la falta de mecanismos de silenciamiento génico en el cloroplasto asegura una expresión estable de los transgenes. Sin embargo, la generación de transformantes de cloroplasto requiere métodos de selección eficientes y, idealmente, métodos para la posterior eliminación de marcadores. Además, el uso de genes reporteros es crítico para lograr una comprensión integral de la expresión génica, informando así el diseño experimental para aplicaciones recombinantes. Esta revisión discute los sistemas de selección y reporteros actualmente disponibles para la ingeniería de cloroplastos en, así como aquellos utilizados para la ingeniería de cloroplastos en plantas superiores y otras microalgas, y mira hacia el futuro en términos de posibles nuevos marcadores y reporteros que avanzarán aún más el cloroplasto como plataforma de expresión.