China es el mayor productor de fresas en el mundo. La pudrición negra de la raíz de la fresa es una enfermedad nueva que ocurre en Hohhot, Mongolia Interior. En el presente estudio, se probaron los efectos inhibitorios de S-16 y su forma fermentada sobre la pudrición negra de la raíz de la fresa. Las tasas de inhibición fueron del 56.31% y 65.95%, respectivamente. Además, se analizaron las sustancias metabólicas utilizando LC-MS/MS. Se identificaron un total de 68 sustancias, incluyendo 18 aminoácidos, 7 de los cuales se ha informado que tienen funciones pro-crecimiento y antibacterianas. Entre estos siete aminoácidos, la N-acetil-D-aloisoleucina (NAD) tuvo el efecto inhibitorio más fuerte. Además, NAD hizo que el micelio de apareciera arrugado y deformado bajo microscopía electrónica. Además, se probó el efecto de NAD sobre . Los resultados indican que NAD tuvo un mejor efecto preventivo cuando se usó con hymexazol. Finalmente, se midió la biomasa fúngica de en las raíces de fresa en diferentes momentos utilizando dos métodos de tratamiento: tratar las raíces de las plantas con NAD y una suspensión de esporas de simultáneamente y con solo. La respuesta de colonización de en términos del gen objetivo EF-1alpha cuando se trató con solo a las 72 hpi fue significativamente mayor que cuando se trató con NAD y una suspensión de esporas de . Los niveles de expresión relativa de los genes relacionados con la defensa en las raíces de fresa tratadas con NAD a las 72 hpi fueron determinados. Los genes NPR1 y PDF1 se regulaban notablemente al alza en comparación con otros genes, lo que sugiere que la expresión de genes relacionados con la resistencia a enfermedades fue activada por NAD, resultando en resistencia a enfermedades en las fresas. Nuestros resultados proporcionan apoyo teórico para el control biológico de la pudrición negra de la raíz de la fresa.