La producción de verduras en invernaderos proporciona cantidades significativas de verduras durante todo el año y mejora los ingresos de los agricultores. Sin embargo, la sobre-fertilización con fertilizantes minerales causa salinización secundaria del suelo y disminuye la estabilidad de la estructura del suelo. Para mejorar la formación de agregados y disminuir la acumulación de sal en el perfil del suelo, se aplicaron fertilizantes bio-orgánicos (frass de larvas con y/o) para sustituir parcialmente el fertilizante mineral en un suelo salinizado para verduras. Se midieron las condiciones de nutrientes del suelo, la estabilidad de los agregados y el movimiento de sal en el perfil del suelo en un sistema de doble pepino en invernadero. Los resultados mostraron que la materia orgánica del suelo (MOS), el nitrógeno total (NT) y el fósforo disponible (FD) aumentaron significativamente bajo tratamientos de fertilizantes bio-orgánicos en comparación con el control. La conductividad eléctrica del suelo (CE) y el contenido total de sal (CTS) disminuyeron entre un 15.74% y un 24.20% y entre un 19.15% y un 29.05%, respectivamente, con fertilizantes bio-orgánicos (< 0.05). El contenido de Cl, NO y SO bajo la doble inoculación con y se redujo en un 31.19%, 26.30% y 53.11%, respectivamente, en comparación con CK (< 0.05). Además, la doble inoculación fue más eficiente en reducir el contenido de nitrato en el perfil del suelo que la inoculación simple. Los microagregados del suelo de 0.25-0.053 mm aumentaron entre un 75.87% y un 78.51% con bio-fertilizantes en comparación con el control, y la doble inoculación fue la mejor para la formación de agregados. En conclusión, la inoculación de microorganismos promotores del crecimiento de las plantas y tolerantes a la sal con frass de larvas de alto contenido de ácido húmico puede aliviar la salinización en el suelo para verduras, mejorar el contenido de nutrientes del suelo y mejorar la estructura del suelo.