Siguiendo los recientes desarrollos y refinamientos, la tecnología de edición genética CRISPR-Cas9 se ha vuelto cada vez más madura y se está utilizando ampliamente para la mejora de cultivos. La aplicación de CRISPR/Cas9 permite la generación de plantas editadas en el genoma sin transgenes en un corto período y tiene las ventajas de simplicidad, alta eficiencia, alta especificidad y bajos costos de producción, lo que facilita enormemente el estudio de las funciones génicas. En la mejora molecular de plantas, la eficiencia de edición genética del sistema CRISPR-Cas9 ha demostrado ser un paso clave para influir en la efectividad de la mejora molecular, con mejoras en la eficiencia de edición genética que recientemente se han convertido en un foco de investigación científica reportada. Esta revisión detalla estrategias y métodos para mejorar la eficiencia de la edición genética CRISPR/Cas9 en la mejora molecular de plantas, incluyendo la ingeniería de enzimas variantes de Cas9, el efecto de múltiples promotores que impulsan Cas9, y estrategias de optimización y expresión eficientes de gRNA. También introduce brevemente las estrategias de optimización del sistema CRISPR/Cas12a y la aplicación de la edición de precisión BE y PE. Estas estrategias son beneficiosas para el desarrollo y optimización adicionales de los sistemas de edición genética en el campo de la mejora molecular de plantas.