La lesión por frío (CI) es un trastorno postcosecha importante en los cítricos, y se ha propuesto que el metabolismo de los ácidos grasos (FA) es un determinante clave de la tolerancia al frío. Hemos investigado esta relación en la fruta del pomelo Star Ruby y encontramos que la sombra de la fruta antes de la cosecha induce la acumulación de licopeno en la cáscara y la tolerancia a CI durante el almacenamiento en frío posterior en comparación con las frutas descubiertas, que eran sensibles a CI. Luego, se examinó el perfil de FA y la expresión de los genes de desaturación de FA en el flavedo de los pomelos cubiertos (C) y no cubiertos (NC) durante 8 semanas de almacenamiento a 2 grados C. El ácido linoleico fue el FA insaturado predominante en el flavedo del pomelo Star Ruby, que se acumuló más en la fruta sensible a CI que en la fruta tolerante a CI en la cosecha y durante todo el período de almacenamiento. Curiosamente, las frutas C y NC también mostraron firmas transcripcionales distintas en la cosecha, lo que sugiere la influencia de factores pre-cosecha. El almacenamiento en frío estimuló la desaturación de FA tanto en las frutas C como en las NC y afectó de manera diferencial la expresión de genes durante el almacenamiento en frío. Estos resultados demuestran que el metabolismo de FA y la regulación de la expresión están estrechamente conectados con factores pre-cosecha que pueden modular la respuesta de los pomelos al almacenamiento en frío postcosecha.