Los microbios realizan funciones diversas y vitales en animales, plantas y humanos, y entre ellos, los microbiomas asociados a plantas, especialmente los endófitos, han atraído un creciente interés científico en los últimos años. Se ha demostrado que numerosas especies de plantas que prosperan en diversos entornos albergan microbios endofíticos. Mientras que las bacterias endofíticas colonizan comúnmente tejidos de plantas como tallos, raíces y hojas, los endófitos asociados a semillas generalmente exhiben una diversidad menor en comparación con los de otros compartimentos de la planta. Sin embargo, los microbios transportados por semillas son de particular importancia, ya que representan el inóculo microbiano inicial que influye en las etapas críticas de desarrollo temprano de una planta. El microbioma endofítico de las semillas es de particular interés debido a su potencial para la transmisión vertical y su capacidad para producir una amplia gama de fitohormonas, enzimas, compuestos antimicrobianos y otros metabolitos secundarios. Colectivamente, estas funciones contribuyen a aumentar la biomasa y el rendimiento de las plantas, especialmente en condiciones de estrés abiótico y biótico. A pesar de sus roles multifacéticos, los microbiomas de semillas siguen siendo poco explorados en la ecología de las plantas, y sus beneficios potenciales aún no se comprenden completamente. Esta revisión destaca los avances recientes en nuestra comprensión de la diversidad, composición de la comunidad, mecanismos de acción y significancia agrícola de los microbios endofíticos de semillas. Además, sintetiza las ideas actuales sobre cómo los endófitos de semillas promueven la salud y productividad de las plantas y propone direcciones de investigación futuras para aprovechar completamente su potencial en la agricultura sostenible.