El presente trabajo describe un sistema experimental que permite la medición de la temperatura en el agua de enfriamiento de los blancos de ciclotrón durante el bombardeo. El sistema desarrollado proporciona una respuesta sensible e inmediata a las variaciones de las condiciones de irradiación durante el bombardeo y permite cuantificar el aumento de temperatura en el agua de enfriamiento debido a la interacción del haz con el blanco irradiado y con su colimador. Tal sistema encuentra aplicación tanto como un dispositivo de monitoreo de seguridad para detectar y registrar instantáneamente alteraciones anormales en las condiciones del blanco para anticipar incidentes relacionados con el calor, como también como una herramienta para validar experimentalmente estudios de optimización de blancos de ciclotrón y simulaciones térmicas.