Desde los primeros momentos de la vida, el contacto con el mundo exterior y con otros individuos invalida la esterilidad de la cavidad oral. La cavidad oral pasa de una condición de esterilidad, que solo está presente durante la vida intrauterina, a una condición en la que una microbiota se organiza y evoluciona, acompañando a la persona a lo largo de su vida. Dependiendo de la edad del paciente, las condiciones sistémicas y/o las condiciones orales, se muestran diferentes características del microbioma oral. Al verificar y analizar este proceso, es posible entender qué está en la base de la etiopatogenia de algunas patologías orales, así como la función del microbioma oral.