Características Genómicas y Función Molecular de una Nueva Cepa Tolerante al Estrés Aislada de un Ambiente Extremo
Autores: Wu, Xiaohui; Wu, Huijun; Wang, Ruoyi; Wang, Zhengqi; Zhang, Yaming; Gu, Qin; Farzand, Ayaz; Yang, Xue; Semenov, Mikhail; Borriss, Rainer; Xie, Yongli; Gao, Xuewen
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 14
Citaciones: Sin citaciones
Debido a su posición topográfica y condiciones climáticas, la meseta Qinghai-Tíbet posee abundantes recursos de microorganismos. La cepa extremófila KKD1 aislada de Hoh Xil presenta una fuerte tolerancia al estrés, lo que le permite propagarse en condiciones de alta salinidad (13%) y alcalinidad (pH 10.0). Además, KKD1 exhibe una prometedora actividad de biocontrol contra patógenos de plantas. Para explorar más a fondo estos rasgos a nivel genómico, realizamos secuenciación y análisis del genoma completo. La identificación taxonómica según la identidad promedio de nucleótidos basada en BLAST reveló que KKD1 pertenece a . El cribado genético de KKD1 reveló que su mecanismo de resistencia al estrés depende del equilibrio osmótico, el transporte de membrana y la regulación del balance iónico bajo estrés salino y alcalino. La expresión de los genes involucrados en estas vías fue analizada utilizando PCR cuantitativa en tiempo real. La presencia de diferentes grupos de genes que codifican metabolitos secundarios antimicrobianos indicó las diversas vías por las cuales KKD1 suprime el crecimiento fitopatógeno. Además, los lipopeptidos surfactina y fengicina fueron identificados como componentes antifúngicos significativos de KKD1. A través del análisis de genómica comparativa, notamos que KKD1 albergaba genes específicos involucrados en la resistencia al estrés y el biocontrol, proporcionando así una nueva perspectiva sobre las características genómicas de las especies extremófilas.
Descripción
Debido a su posición topográfica y condiciones climáticas, la meseta Qinghai-Tíbet posee abundantes recursos de microorganismos. La cepa extremófila KKD1 aislada de Hoh Xil presenta una fuerte tolerancia al estrés, lo que le permite propagarse en condiciones de alta salinidad (13%) y alcalinidad (pH 10.0). Además, KKD1 exhibe una prometedora actividad de biocontrol contra patógenos de plantas. Para explorar más a fondo estos rasgos a nivel genómico, realizamos secuenciación y análisis del genoma completo. La identificación taxonómica según la identidad promedio de nucleótidos basada en BLAST reveló que KKD1 pertenece a . El cribado genético de KKD1 reveló que su mecanismo de resistencia al estrés depende del equilibrio osmótico, el transporte de membrana y la regulación del balance iónico bajo estrés salino y alcalino. La expresión de los genes involucrados en estas vías fue analizada utilizando PCR cuantitativa en tiempo real. La presencia de diferentes grupos de genes que codifican metabolitos secundarios antimicrobianos indicó las diversas vías por las cuales KKD1 suprime el crecimiento fitopatógeno. Además, los lipopeptidos surfactina y fengicina fueron identificados como componentes antifúngicos significativos de KKD1. A través del análisis de genómica comparativa, notamos que KKD1 albergaba genes específicos involucrados en la resistencia al estrés y el biocontrol, proporcionando así una nueva perspectiva sobre las características genómicas de las especies extremófilas.