La pudrición de la corona (FCR), causada principalmente por , ha surgido como una nueva amenaza para la producción y calidad del trigo en el norte de China. El mejoramiento genético de la resistencia del trigo a la FCR sigue siendo el enfoque más efectivo para el control de la enfermedad. En este estudio, fenotipamos 435 cultivares de trigo chinos a través de la inoculación de FCR en la etapa de plántula en un invernadero. Nuestros hallazgos revelaron que solo aproximadamente el 10.8% de los germoplasmas de trigo mostraron resistencia moderada o alta a la FCR. Un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS) utilizando SNP de alta densidad de 660K llevó al descubrimiento de un nuevo locus de rasgo cuantitativo en el brazo largo del cromosoma 3B, designado como . Un total de 12 SNPs significativamente asociados se agruparon estrechamente dentro de un intervalo físico de 1.05 Mb. Se desarrollaron marcadores moleculares basados en SNP para facilitar la aplicación práctica de . Entre los cinco genes candidatos de resistencia a la FCR dentro del , nos centramos en el que codifica una proteína quinasa, debido a su patrón de expresión. La validación funcional reveló dos transcritos, y , con roles opuestos en la resistencia de las plantas a la enfermedad fúngica. Estos hallazgos proporcionan información sobre la base genética de la resistencia a la FCR en el trigo y ofrecen recursos valiosos para la cría de variedades resistentes.