El hongo filamentoso Trichoderma reesei es uno de los microorganismos celulolíticos mejor estudiados. Es el hongo más importante para la producción industrial de enzimas para la deconstrucción de biomasa siendo ampliamente utilizado en la industria biotecnológica, principalmente en la producción de biocombustibles. Aquí, realizamos una revisión analítica del sistema holocelulolítico presentado por T. reesei así como de los mecanismos transcripcionales y de señalización implicados en la expresión de holocelulasa en este hongo. También discutimos nuevas perspectivas sobre el control de la secreción y la expresión de la celulasa basadas en datos de RNA-seq y caracterización funcional del crecimiento de T. reesei en diferentes fuentes de carbono, que comprenden glucosa, celulosa, soforosa y bagazo de caña de azúcar.