La seguridad alimentaria es una de las principales preocupaciones en el mundo y en el vino depende principalmente de metabolitos de origen microbiano. El objetivo de este estudio fue investigar la presencia de contaminantes naturales, ocratoxina A y aminas biogénicas (cadaverina, histamina, putrescina y tiramina), en vinos tintos comerciales croatas originarios de diferentes regiones vinícolas croatas. La ocratoxina A se detectó en el 92.8% de las muestras, sin embargo, sus concentraciones en todas las muestras fueron más de 10 veces más bajas que el límite establecido por la Unión Europea (2 ug/kg), lo que marca a estos vinos como seguros para el consumo. La frecuencia de presencia y las concentraciones medidas de ocratoxina A fueron más altas en vinos producidos en regiones del sur con los valores más altos obtenidos en vinos de las islas del sur de Dalmacia. Todas las muestras estaban contaminadas con cadaverina y putrescina, mientras que el 88.2% y el 82.7% estaban contaminadas con histamina y tiramina, respectivamente. Las concentraciones de histamina variaron desde por debajo del límite de detección hasta 8.5 mg/L. Se midieron concentraciones más altas de histamina en vinos con valores de pH más altos, lo que coincidía con el origen geográfico del sur. Estos resultados refuerzan la necesidad de la detección y cuantificación rutinaria de aminas biogénicas en los vinos croatas para lograr un mejor control de la vinificación y minimizar su formación.