Las operaciones logísticas son fundamentales para los sistemas de fabricación, particularmente en los procesos de transporte que ocurren no solo entre instalaciones y partes interesadas, sino también entre almacenes y estaciones de trabajo dentro de una instalación. El diseño de áreas funcionales y la asignación de bienes a zonas apropiadas dentro del sistema de gestión de almacenes (WMS) son actividades críticas que influyen sustancialmente en la eficiencia de las operaciones logísticas de fabricación. Este estudio desarrolla un modelo de programación entera mixta (MIP) para optimizar el flujo de materiales y la ruta de productos en la fabricación. El modelo identifica caminos eficientes, asigna productos a rutas y determina el equipo de manipulación de materiales requerido. Se implementa en Python (3.11.5) utilizando el paquete Pyomo (6.7.3) y el solucionador CBC (2.10.11), con un análisis de sensibilidad realizado sobre las restricciones y variables de decisión para evaluar la robustez. Los hallazgos indican que el Flujo de Material 3 y el Equipo de Manipulación de Material 1 representan las configuraciones óptimas para gestionar la mayoría de los bienes dentro del sistema de fabricación. El modelo matemático propuesto apoya el proceso de toma de decisiones al permitir ajustes en las proporciones de áreas funcionales dentro del sistema logístico de fabricación, asegurando eficiencia operativa y flexibilidad en respuesta a las demandas cambiantes. Además, el estudio ofrece perspectivas gerenciales y sugiere direcciones para futuras investigaciones.