La salinidad es un factor ambiental importante que influye en el crecimiento y rendimiento de los cultivos. La malato deshidrogenasa (MDH) cataliza la conversión reversible de oxaloacetato (OAA) a malato. Aunque se han identificado muchas MDHs en varias plantas, la función bioquímica de la MDH en el arroz sigue sin caracterizarse, y su papel en el crecimiento y la respuesta al estrés salino está en gran medida inexplorado. En este estudio, se determinó la función bioquímica de la MDH, revelando su participación en la regulación del número de macollos y la tolerancia a la sal en el arroz. La MDH se localiza en el peroxisoma y se expresa en varios órganos. El análisis in vitro confirmó que la MDH convierte OAA en malato. Las plántulas de plantas que sobreexpresan MDH tenían longitudes de tallo más cortas y pesos frescos más bajos que las plantas tipo salvaje (WT), mientras que los mutantes mostraron lo contrario. A la madurez, las plantas que sobreexpresan MDH tenían menos macollos que las WT, mientras que los mutantes tenían más, lo que sugiere el papel de la MDH en la regulación del número de macollos. Además, las plantas que sobreexpresan MDH eran sensibles al estrés salino, pero los mutantes mostraron una tolerancia mejorada a la sal. La relación de contenido de Na/K aumentó en las plantas que sobreexpresan MDH y disminuyó en los mutantes, lo que sugiere que la MDH podría afectar negativamente la tolerancia a la sal al influir en el equilibrio Na/K. Estos hallazgos sugieren el potencial de la MDH como una herramienta genética para mejorar el crecimiento y la tolerancia a la sal en el arroz.