Madagascar es un hotspot de biodiversidad, que contiene una gran proporción de especies endémicas. Para hacer que los esfuerzos de conservación sean más efectivos, es necesario entender la distribución espacial de esta enorme biodiversidad. En este estudio, se evaluaron y compararon los patrones de variación morfológica y diversidad en los anuros adultos de Madagascar a través de diferentes regiones climáticas. Estos patrones fueron investigados para 370 especies (2360 especímenes), y se evaluó la variación en 13 rasgos morfológicos obtenidos de bases de datos taxonómicas. Los resultados revelaron diferencias en la distribución del tamaño corporal a través de las regiones climáticas y que las especies más morfológicamente distintivas ocurren en regiones húmedas. El análisis también mostró que los ensamblajes de anuros tienden a ser más ricos en especies, más morfológicamente diversos y más morfológicamente agrupados en selvas tropicales. Estos patrones son atribuibles a variaciones regionales en la cantidad y estacionalidad de la precipitación. Comprender los complejos patrones de diversidad espacial podría ser útil para la priorización regional en la conservación de los anuros de Madagascar.