Las proteínas de origen animal representan componentes fisiológicamente activos en la dieta humana; ejercen una acción directa o constituyen un sustrato para la hidrólisis enzimática durante el procesamiento y consumo de alimentos. Los péptidos bioactivos pueden derivar de la hidrólisis por enzimas digestivas, enzimas endógenas de materias primas alimentarias crudas y enzimas de microorganismos añadidos durante el procesamiento de alimentos. Las proteínas de la leche tienen diferentes polimorfismos para cada especie láctea que influyen en la cantidad y características bioquímicas (por ejemplo, cadena de aminoácidos, fosforilación y glicosilación) de la proteína. La leche de otras especies alternativas a la vaca ha sido aprovechada por su papel en niños con alergia a la leche de vaca y en algunas patologías infantiles, como la epilepsia, mediante el monitoreo del estado inmunológico. Diferentes mecanismos contribuyen a la generación de péptidos bioactivos a partir de la carne y productos cárnicos, y su funcionalidad y aplicación como ingredientes funcionales han demostrado efectos en la salud del consumidor. Las proteínas de alimentos de origen animal son actualmente la principal fuente de una variedad de péptidos biológicamente activos que han ganado un interés especial debido a que también pueden influir en numerosas respuestas fisiológicas en el organismo. La adición de probióticos a productos alimenticios de origen animal representa una estrategia para aumentar las moléculas con propiedades saludables y funcionales.