Perfil Dinámico del Transcriptoma Mamario del Yak durante el Ciclo de Lactancia
Autores: Xia, Wei; Liu, Yili; Loor, Juan J.; Bionaz, Massimo; Jiang, Mingfeng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Transcriptoma
Ciclo de lactancia
Tejido mamario
DEGs
Análisis bioinformático
Análisis funcional
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
El objetivo de este estudio fue evaluar el transcriptoma del tejido mamario de cuatro yaks durante todo el ciclo de lactancia. Para este propósito, se realizaron biopsias de la glándula mamaria en -30, -15, 1, 15, 30, 60, 120, 180 y 240 días en relación con el parto (d). El análisis del transcriptoma se realizó utilizando una plataforma comercial de microarreglos bovinos y los resultados se analizaron utilizando varias herramientas bioinformáticas. El análisis estadístico utilizando una tasa global de descubrimiento falso identificó 6000 genes expresados diferencialmente (DEGs) a lo largo de la lactancia, con un gran número de DEGs observados al inicio (1 d vs. -15 d) y al final de la lactancia (240 d vs. 180 d). El análisis bioinformático reveló un papel importante de los genes asociados con BTA3, BTA4, BTA6, BTA9, BTA14 y BTA28 en la lactancia. El análisis funcional de los DEG subrayó una inducción general del metabolismo de lípidos, sugiriendo un aumento en la síntesis de triglicéridos, probablemente regulado por la señalización de PPAR. El mismo análisis reveló una inducción del metabolismo de aminoácidos y la secreción de proteínas, con una disminución concomitante en el proteasoma, indicando un papel importante en el manejo de aminoácidos y una reducción en la degradación de proteínas en la síntesis y secreción de proteínas lácteas. La biosíntesis de glicanos fue inducida tanto para N-glicanos como para O-glicanos, sugiriendo un aumento en el contenido de glicanos en la leche. El ciclo celular y la respuesta inmune, especialmente el procesamiento y presentación de antígenos, fueron fuertemente inhibidos durante la lactancia, sugiriendo que los cambios morfológicos se minimizan durante la lactancia, mientras que la glándula mamaria previene la hiperrespuesta inmune. Los transcritos asociados con la respuesta a la radiación y el bajo oxígeno se enriquecieron en los DEG regulados a la baja afectados por la etapa de lactancia. Excepto por este último hallazgo, las funciones afectadas por la adaptación transcriptómica a la lactancia en el tejido mamario de yak son muy similares a las observadas en vacas lecheras.
Descripción
El objetivo de este estudio fue evaluar el transcriptoma del tejido mamario de cuatro yaks durante todo el ciclo de lactancia. Para este propósito, se realizaron biopsias de la glándula mamaria en -30, -15, 1, 15, 30, 60, 120, 180 y 240 días en relación con el parto (d). El análisis del transcriptoma se realizó utilizando una plataforma comercial de microarreglos bovinos y los resultados se analizaron utilizando varias herramientas bioinformáticas. El análisis estadístico utilizando una tasa global de descubrimiento falso identificó 6000 genes expresados diferencialmente (DEGs) a lo largo de la lactancia, con un gran número de DEGs observados al inicio (1 d vs. -15 d) y al final de la lactancia (240 d vs. 180 d). El análisis bioinformático reveló un papel importante de los genes asociados con BTA3, BTA4, BTA6, BTA9, BTA14 y BTA28 en la lactancia. El análisis funcional de los DEG subrayó una inducción general del metabolismo de lípidos, sugiriendo un aumento en la síntesis de triglicéridos, probablemente regulado por la señalización de PPAR. El mismo análisis reveló una inducción del metabolismo de aminoácidos y la secreción de proteínas, con una disminución concomitante en el proteasoma, indicando un papel importante en el manejo de aminoácidos y una reducción en la degradación de proteínas en la síntesis y secreción de proteínas lácteas. La biosíntesis de glicanos fue inducida tanto para N-glicanos como para O-glicanos, sugiriendo un aumento en el contenido de glicanos en la leche. El ciclo celular y la respuesta inmune, especialmente el procesamiento y presentación de antígenos, fueron fuertemente inhibidos durante la lactancia, sugiriendo que los cambios morfológicos se minimizan durante la lactancia, mientras que la glándula mamaria previene la hiperrespuesta inmune. Los transcritos asociados con la respuesta a la radiación y el bajo oxígeno se enriquecieron en los DEG regulados a la baja afectados por la etapa de lactancia. Excepto por este último hallazgo, las funciones afectadas por la adaptación transcriptómica a la lactancia en el tejido mamario de yak son muy similares a las observadas en vacas lecheras.